Novel collection of hcdr3 regions and uses therefor

C - Chemistry – Metallurgy – 07 – K

Patent

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Details

C07K 16/00 (2006.01)

Patent

CA 2634387

The present invention is directed to the preparation and use of a collection of antibody heavy chain complementarity determining region 3 (HCDR3) members, where diversity of the collection is a function of the length of the HCDR3 members. The diversity of the collection of HCDR3 regions substantially represents the natural amino acid distribution of HCDR3 in the human repertoire. This natural amino acid distribution can be represented by biasing the complete random distribution of amino acids, accordingly, in the HCDR3 encoding DNA sequence by using trinucleotide mutagenesis (TRIM) technology. A collection of HCDR3 members of the invention each can be comprised within a variable region of an antibody (or fragment thereof) to form a library of synthetic antibodies or antibody fragments. Synthetic antibody libraries of the present invention may be designed to include modular features, such as chemically synthesized "master gene" framework regions, which may contain unique restriction sites flanking one or more CDR regions, including an HCDR3 region prepared as described herein. The invention also provides nucleic acid molecules encoding such diverse collection and methods of making and using the same.

La présente invention concerne la préparation et l'utilisation d'un ensemble d'éléments de la région 3 à chaîne lourde de détermination de la complémentarité à l'anticorps, où la diversité de l'ensemble dépend de la longueur des éléments des HCDR3. La diversité de l'ensemble des régions HCDR3 représente essentiellement la distribution en acides aminés naturels des HCDR3 dans le répertoire humain. Cette distribution en acides aminés naturels peut être représentée en biaisant en conséquence la distribution complètement aléatoire en acides aminés dans la séquence ADN codant pour les HCDR3 en utilisant la technologie de mutagénèse de trinucléotides (TRIM). Un ensemble d'éléments HCDR3 selon l'invention peuvent chacun être compris à l'intérieur d'une région variable d'un anticorps (ou fragment de celui-ci) afin de former une librairie d'anticorps ou de fragments d'anticorps de synthèse. Les librairies d'anticorps de synthèse selon la présente invention peuvent être conçues pour comprendre des caractéristiques modulaires, telles que des régions charpentes du 'gène maître' synthétisées chimiquement, qui peuvent contenir des sites de restriction uniques flanquant une ou plus des régions CDR, comprenant une région HCDR3 préparée selon ce qui est décrit ici. L'invention concerne également des molécules d'acides nucléiques codant pour un tel ensemble diversifié et des méthodes de fabrication et d'utilisation de celles-là.

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