Isolation and use of sh3 binding peptides

Details Isolation and use of sh3 binding peptides Isolation and use of sh3 binding peptides

C - Chemistry, Metallurgy

07

K

C07K 7/08 (2006.01) A61K 38/10 (2006.01) A61P 35/00 (2006.01) C07K 7/06 (2006.01) C07K 14/00 (2006.01) C07K 14/435 (2006.01) G01N 33/53 (2006.01) G01N 33/566 (2006.01)

Patent

CA 2246378

Peptides having general and specific binding affinities for the Src homology region 3 (SH3) domains of proteins are disclosed in the present invention. In particular, SH3 binding peptides have been isolated from phage-displayed random peptide libraries which had been screened for isolates that bind to bacterial fusion proteins comprising SH3 and glutathione S-transferase (GST). Preferred peptides are disclosed which comprise a core 7-mer sequence (preferably, a consensus motif) and two or more, preferably at least six, additional amino acid residues flanking the core sequence, for a total length of 9, preferably at least 13, amino acid residues and no more than about 45 amino acid residues. Such peptides manifest preferential binding affinities for certain SH3 domains. The preferred peptides exhibit specific binding affinities for the Src-family of proteins. In vitro and in vivo results are presented which demonstrate the biochemical activity of such peptides.

L'invention se rapporte à des peptide ayant des affinités de liaision générales et spécifiques pour les domaines de protéines de la région à homologie Scr 3 (SH3). En particulier, les peptides de liaison de SH3 ont été isolés à partir de banques de peptides non ordonnés apparaissant sur phages et qui ont été criblés pour des isolats qui se lient aux protéines de fusion bactériennes comprenant SH3 et glutathione S-transférase (GST). L'invention se rapporte également à des peptides préférés qui comprennent une séquence noyau 7-mer (de préférence, un motif de consensus) et au moins deux, de préférence au moins six, restes d'acides aminés supplémentaires entourant la séquence noyau, pour une longueur totale de 9, de préférence au moins 13, restes d'acides aminés et pas plus d'environ 45 restes d'acides aminés. Ces peptides présentent des affinités de liaison préférentielles pour certains domaines de SH3. Les peptides préférés présentent des affinités de liaison spécifiques pour la famille Src de protéines. Les résultats obtenus in vivo et in vitro mettent en évidence l'activité biochimique de ces peptides.

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