Virtual dna sequencer

G - Physics – 06 – F

Patent

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Details

G06F 19/00 (2006.01) G01N 27/447 (2006.01)

Patent

CA 2240378

A virtual DNA sequencer combines a plurality of individual DNA sequencers. Samples of DNA or other nucleic acid from subjects are prepared and allocated in real time to particular lanes or sets of lanes in electrophoresis plates of the individual sequencers, with records kept of the allocations. The data resulting from the electrophoresis runs is collected and collated according to the identities of the subjects. The individual sequencers are networked, and each individual sequencer is preferably equipped with a data buffer large enough to accommodate all or substantially all of a data run, thus protecting the virtual sequencer from loss of valuable data in the event that the network is disrupted for some portion of the time of the data run. In this way, a plurality of sequencers is virtually the same as a single sequencer with a very large number of tracks each of which can run for a much longer sequencing run than an individual sequencer.

Un séquenceur virtuel d'ADN combine plusieurs séquenceurs d'ADN individuels. Des échantillons d'ADN ou d'autres acides nucléiques, provenant de sujets, sont préparés et plusieurs pistes ou ensembles de pistes particulières leur sont allouées en temps réel sur les plaques d'électrophorèse de séquenceurs individuels, en enregistrant les allocations. Les données résultant des opérations d'électrophorèse sont recueillies et assemblées selon les identités des sujets. Les séquenceurs individuels sont mis en réseaux et chaque séquenceur individuel est équipé, de préférence, d'une mémoire tampon pour données suffisamment importante pour mémoriser toutes, ou sensiblement toutes, les données d'une opération d'électrophorèse, en protégeant ainsi le séquenceur virtuel d'une perte d'information utile en cas de perturbation du réseau pendant une certaine durée de temps, au cours de l'opération de traitement des données. De cette manière, la pluralité des séquenceurs est virtuellement identique à un seul séquenceur avec un très grand nombre de pistes et ces séquenceurs peuvent être utilisés pour une opération d'électrophorèse beaucoup plus longue qu'un séquenceur individuel.

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