C - Chemistry – Metallurgy – 07 – H
Patent
C - Chemistry, Metallurgy
07
H
C07H 21/04 (2006.01) C12Q 1/68 (2006.01)
Patent
CA 2193101
The present invention relates to a method for detection and identification of at least one microorganism, or for the simultaneous detection of several microorganisms in a sample, comprising the steps of: (1) if need be releasing, isolating or concentrating the polynucleic acids present in the sample; (ii) if need be amplifying the 16S-23S rRNA spacer region, or a part of it, with at least one suitable primer pair, (iii) hybridizing the polynucleic acids of step (i) or (ii) with at least one and preferably more than one of the spacer probes as mentioned in table la or equivalents of thereof, under the appropriate hybridization and wash conditions, and/or with a taxon-specific probe derived from any of the spacer sequences as represented in figs. 1-103 under the same hybridization and wash conditions; (iv) detecting the hybrids formed in step (iii) with each of the probes used under appropriate hybridization and wash conditions; (v) identification of the microorganism(s) present in the sample from the differential hybridization signals obtained in step (iv).
L'invention se rapporte à un procédé de détection et d'identification d'au moins un micro-organisme, ou de détection simultanée de plusieurs micro-organismes dans un échantillon, ce procédé comprenant les étapes consistant : (i) si nécessaire, à libérer, isoler ou concentrer les acides polynucléiques présents dans l'échantillon; (ii) si nécessaire, à amplifier la région espaceur de l'ARNr 16S-23S, ou une partie de celle-ci, à l'aide d'au moins une paire d'amorces appropriées; (iii) à hybrider les acides polynucléiques des étapes (i) ou (ii) à l'aide d'une et/ou de préférence de plusieurs sonde(s) espaceur, comme mentionné sur le tableau 1a, ou à l'aide d'équivalents de celle(s)-ci, dans des conditions appropriées d'hybridation et de lavage, et/ou d'une sonde spécifique du taxon dérivée de l'une quelconque des séquences espaceur, comme représenté sur les figures 1 à 103, dans des conditions identiques d'hybridation et de lavage; (iv) à détecter les hybrides qui se sont formés pendant l'étape (iii) à l'aide de chacune des sondes utilisées dans des conditions appropriées d'hybridation et de lavage; et (v) à identifier le(s) micro-organisme(s) présent(s) dans l'échantillon à partir des signaux différentiels d'hybridation obtenus dans l'étape (iv).
Jannes Geert
Rossau Rudi
Van Heuverswyn Hugo
Fetherstonhaugh & Co.
Innogenetics N.v.
LandOfFree
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Profile ID: LFCA-PAI-O-1447266