C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q
Patent
C - Chemistry, Metallurgy
12
Q
C12Q 1/68 (2006.01) B01J 19/00 (2006.01) C07H 21/00 (2006.01) C07H 21/04 (2006.01) C12N 15/10 (2006.01) C12N 15/66 (2006.01)
Patent
CA 2202167
The invention provides a method of tracking, identifying, and/or sorting classes or subpopulations of molecules by the use of oligonucleotide tags. Oligonucleotide tags of the invention each consist of a plurality of subunits 3 to 6 nucleotides in length selected from a minimally cross-hydridizing set. A subunit of a minimally cross-hybridizing set forms a duplex or triplex having two or more mismatches with the complement of any other subunit of the same set. The number of oligonucleotide tags available in a particular embodiment depends on the number of subunits per tag and on the length of the subunit. An important aspect of the invention is the use of the oligonucleotide tags for sorting polynucleotides by specifically hybridizing tags attached to the polynucleotides to their complements on solid phase supports. This embodiment provides a readily automated system for manipulating and sorting polynucleotides, particularly useful in large-scale parallel operations, such as large-scale DNA sequencing, mRNA fingerprinting, and the like, wherein many target polynucleotides or many segments of a single target polynucleotide are sequenced simultaneously.
La présente invention concerne un procédé de traçage, d'identification et/ou de classification de sous-populations de molécules à l'aide de marqueurs oligonucléotides. Les marqueurs oligonucléotides utilisés dans ce procédé sont composés d'une pluralité de sous-unités d'une longueur de 3 à 6 nucléotides choisis dans un ensemble d'hybridation croisée minimale. Une sous-unité d'ensemble d'hybridation croisée minimale forme un duplex ou triplex possédant deux non-appariements ou plus avec le complément de toute autre sous-unité de même ensemble. Le nombre de marqueurs oligonucléotides disponibles dans un procédé de réalisation donné dépend du nombre de sous-unités par marqueur et de la longueur de la sous-unité. Une caractéristique importante de cette invention concerne l'utilisation des marqueurs oligonucléotides pour classer des polynucléotides à l'aide de marqueurs liés aux polynucléotides et hybridés spécifiquement à leurs compléments sur supports en phase solide. Ce mode de réalisation fournit un système facilement automatisable de manipulation et de classification de polynucléotides, particulièrement utile dans les opérations parallèles à grande échelle, telles que les séquençage de l'ADN à grande échelle, la détermination de la localisation des ARNm et autres opérations semblables, dans lesquelles de nombreux polynucléotides cibles ou de nombreux segments d'un polynucléotide unique cible font l'objet d'un séquençage simultané.
Gowling Lafleur Henderson Llp
Lynx Therapeutics Inc.
LandOfFree
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Profile ID: LFCA-PAI-O-1496423