G - Physics – 06 – F
Patent
G - Physics
06
F
G06F 19/00 (2006.01) G06F 17/27 (2006.01) G06F 17/30 (2006.01)
Patent
CA 2396495
Methods and system for automated inference of physico-chemical interaction knowledge from databases of term co-occurrence data. The co-occurrence data includes co-occurrences between chemical or biological molecules or co- occurrences between chemical or biological molecules and biological processes. Likelihood statistics are determined and applied to decide if co-occurrence data reflecting physico-chemical interactions is non-trivial. A next node or an unknown target representing chemical or biological molecules in a biological pathway is selected based on co-occurrence values. The method and system may be used to further facilitate a user's understanding of biological functions, such as cell functions, to design experiments more intelligently and to analyze experimental results more thoroughly. Specifically, the present invention may help drug discovery scientists select better targets for pharmaceutical intervention in the hope of curing diseases. The method and system may also help facilitate the abstraction of knowledge from information for biological experimental data and provide new bioinformatic techniques.
L'invention concerne des procédés et un système d'inférences automatisées des connaissances d'interactions physico-chimiques provenant de bases de données de données de co-occurences de termes. Les données de co-occurences comprennent des co-occurences entre des molécules chimiques et biologiques, ou des co-occurences entre des molécules chimiques ou biologiques et des processus biologiques. Des statistiques de ressemblance sont déterminées et appliquées pour décider si des données de co-occurences reflétant des interactions physico-chimiques ne sont pas insignifiantes. Un autre noeud ou une cible inconnue représentant des molécules chimiques ou biologiques dans une voie de passage biologique est sélectionné en fonction des valeurs de co-occurences. Ce procédé et ce système peuvent être utilisés pour faciliter la compréhension des fonctions biologiques par un utilisateur, telles que les fonctions cellulaires, afin de concevoir des expériences plus intelligemment et d'analyser plus en profondeur des résultats expérimentaux. Notamment, le procédé de la présente invention peut aider des scientifiques travaillant dans le domaine de la recherche pharmaceutique à sélectionner de meilleures cibles d'intervention pharmaceutique dans l'espoir de guérir des maladies. Ce procédé et ce système peuvent aussi faciliter la compréhension de concepts abstraits de la connaissance à partir d'informations de données biologiques expérimentales et produire de nouvelles techniques bio-informatiques.
Cellomics Inc.
Mbm & Co.
LandOfFree
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