New nmr screening method

Details New nmr screening method New nmr screening method

G - Physics

01

N

G01N 33/50 (2006.01) G01N 33/58 (2006.01) G01N 33/68 (2006.01) G01R 33/46 (2006.01) G01R 33/465 (2006.01)

Patent

CA 2424562

The invention refers to a method for identifying at least one binder molecule comprising the steps of: (a) choosing two amino acid types (AA1 and AA2) in a polypeptide or protein of interest, whereby AA2 at least once occurs directly subsequent to AA1 in the amino acid sequence of the polypeptide or protein, defining an amino acid pair AA1-AA2; (b) labelling the two amino acid types (AA1 and AA2) in the polypeptide or protein of interest, whereby all AA1- residues is labelled with 13C and all AA2-residues with 15N; (c) generating a first HNCO-type NMR spectrum of the labelled polypeptide or protein from step (b), thereby identifying signals from the labelled amino acidpair AA1-AA2; (d) contacting the labelled polypeptide or protein with a potential binder molecule or a mixture of binder molecules under conditions and sufficient time for allowing binding of the potential binder molecule(s) and the labelled polypeptide or protein; (e) generating a second HNCO-type NMR spectrum, or a 1H-15N correlation type NMR spectrum, of the mix from step (d), monitoring signals identified in step (c); (f) comparing the first and the second NMR spectra, whereby a chemical shift change of the signals identified in step (c) between the two spectra indicates an interaction between the potential binder molecule and the labelled polypeptide or protein.

L'invention se rapporte à une méthode d'identification d'au moins une molécule de liaison comprenant les étapes suivantes: (a) choisir deux types d'acide aminé (AA1 et AA2) dans un polypeptide ou une protéine à examiner, AA2 apparaissant au moins une fois directement après AA1 dans la séquence d'acides aminés du polypeptide ou de la protéine, définissant ainsi une paire d'acides aminés AA1-AA2; (b) marquer les deux types d'acides aminés (AA1 et AA2) dans le polypeptide ou la protéine à examiner, tous les résidus d'AA1 étant marqués au moyen de ?13¿C et tous les résidus d'AA2 au moyen de ?15¿N; (c) générer un premier spectre IRM de type HNCO pour le polypeptide ou de la protéine marqués à l'étape (b), identifiant ainsi les signaux provenant de la paire d'acides aminés marqués AA1-AA2; (d) mettre en contact le polypeptide ou la protéine marquée avec une molécule de liaison potentielle ou d'un mélange de molécules de liaison dans des conditions et un temps suffisant pour permettre la liaison de la ou des molécule(s) de liaison potentielle(s) et du polypeptide ou de la protéine marqués; (e) générer un second spectre IRM de type HNCO, ou un spectre IRM de type à corrélation ?1¿H-?15¿N, pour le mélange provenant de l'étape (d), suivre les signaux identifiés à l'étape (c); (f) comparer les premier et second spectres IRM, un changement de déplacement chimique des signaux identifiés à l'étape (c) entre les deux spectres indique une interaction entre la molécule de liaison potentielle et le polypeptide ou la protéine marqués.

Affiliated with

Also associated with

Rating

New nmr screening method does not yet have a rating. At this time, there are no reviews or comments for this patent.

If you have personal experience with New nmr screening method, we encourage you to share that experience with our LandOfFree.com community. Your opinion is very important and New nmr screening method will most certainly appreciate the feedback.

Rate now

Comments { 0 }

Profile ID: LFCA-PAI-O-1562104