Crystallizable compositions comprising a caspase-7

C - Chemistry – Metallurgy – 12 – N

Patent

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Details

C12N 9/64 (2006.01) C12Q 1/37 (2006.01) G06F 17/50 (2006.01)

Patent

CA 2389569

The present invention relates to a data storage medium encoded with the structural coordinates of crystallized molecules and molecular complexes which comprise the active site binding pockets of caspase-7. Such data storage material is capable of displaying such molecules and molecular complexes, or their structural homologues, as a graphical three-dimensional representation on a computer screen. This invention also relates to methods of using the structure coordinates to solve the structure of similar or homologous proteins or protein complexes. In addition, this invention relates to methods of using the structure coordinates to screen and design compounds, including inhibitory compounds, that bind to caspase-7 or homologues thereof. This invention also relates to molecules or molecular complexes which comprise the active site binding pockets of caspase-7 or close structural homologues of the active site binding pockets. The present invention also relates to compositions and crystals of a caspase-7 in complex with a caspase inhibitor. This invention also relates to compounds and pharmaceutical compositions which are inhibitors of caspase-7.

La présente invention concerne un support de stockage de données codé avec les coordonnées structurelles de molécules cristallisées et de complexes moléculaires comprenant des poches de liaison de site actif de caspase-7. Ce support de stockage de données est capable d'afficher ces molécules et ces complexes moléculaires, ou leurs homologues structuraux, sous la forme d'une représentation tridimensionnelle sur un écran d'ordinateur. Cette invention concerne également des procédés d'utilisation de coordonnées structurelles permettant de résoudre la structure des protéines similaires ou homologues ou des complexes protéiques, ainsi que des procédés d'utilisation de ces coordonnées structurelles permettant de cribler et de concevoir des composés, tels que des composés inhibiteurs, qui se lient à la caspase-7 ou à ses homologues. Cette invention concerne, en outre, des molécules et des complexes moléculaires qui comprennent les poches de liaison de site actif de la caspase-7 ou de proches homologues structurels des poches de liaison de site actif. Cette invention concerne enfin des compositions et des cristaux de caspase-7 en complexe avec des inhibiteurs de caspase-7, ainsi que des composés et des compositions pharmaceutiques qui sont des inhibiteurs de caspase-7.

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