Dna and rna conformational switches as sensitive electronic...

C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q

Patent

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Details

C12Q 1/68 (2006.01)

Patent

CA 2516091

The electrical conductivity of DNA and other oligonucleotide constructs is dependent on its conformational state. Such a dependence may be harnessed for the electronic sensing of external analytes, for instance, adenosine. Such a DNA sensor incorporates an analyte receptor, whose altered conformation in the presence of bound analyte switches the conformation, and hence, the conductive path between two oligonucleotide stems, such as double-helical DNA. Two distinct designs for such sensors are described that permit significant electrical conduction through a first or "detector" double-helical stem only in the presence of the bound analyte. In the first design, current flows through the analyte receptor itself whereas, in the second, current flows in a path adjacent to the receptor. The former design may be especially suitable for certain categories of analytes, including heterocycle-containing compounds such as adenosine, whereas the latter design should be generally applicable to the detection of any molecular analyte, large or small. Since analyte detection in these DNA sensors is electronic, the potential exists for their application in rapid and automated chip-based detection of small molecules as well as of proteins and other macromolecules.

L'invention concerne la dépendance de la conductivité électrique de l'ADN et d'autres constructions oligonucléotidiques de son état conformationnel. Une telle dépendance peut être liée à la détection électronique d'analytes externes, par exemple, de l'adénosine. Un tel capteur d'ADN intègre un récepteur d'analyte dont la conformation altérée en présence d'un analyte lié commute la conformation, et par conséquent, le trajet conducteur entre deux souches oligonucléotidiques, notamment un ADN à double hélice. L'invention concerne deux conceptions distinctes pour de tels capteurs permettant la conduction électrique significative à travers une première souche à double hélice ou <= de détection >= uniquement en présence de l'analyte lié. Dans la première conception, le courant s'écoule à travers le récepteur d'analyte alors que dans la seconde conception, le courant s'écoule dans un trajet adjacent au récepteur. La première conception peut se prêter à certaines catégories d'analytes, y compris des composés contenant un hétérocycle, dont l'adénosine, alors que la seconde conception devrait s'appliquer de manière générale à la détection d'un analyste moléculaire quelconque, grand ou petit. Etant donné le caractère électronique de la détection d'analyte dans ces capteurs d'ADN, il est possible de les utiliser dans la détection rapide et automatisée utilisant une puce de petites molécules ainsi que de protéines et d'autres macromolécules.

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