Method for detecting nucleic acid target sequences involving...

C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q

Patent

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C12Q 1/68 (2006.01)

Patent

CA 2381954

Disclosed is a complex formed by a hybridisation reac-tion comprising four nucleic acid molecules; the complex comprising a target nucleic acid molecule and first, second and third nucleic acid probe molecules; wherein the first probe comprises a foot region which is com-plementary to a first portion of the target and is hybridised thereto, and an arm region which is substantially non-complementary to the target; the second probe comprises a foot region which is complementary to a second portion of the target, such that the foot region of the second probe is hybridised to the target adjacent or substantially adjacent to the foot region of the first probe, the second probe also comprising an arm region which is substantially non-complementary to the target but which is com-plementary and hybridised to the arm region of the first probe; the third probe being complementary, at least in part, to a portion of the arm region of the first probe, such that third probe is hybridised to the arm region of the first probe adjacent or substantially adjacent to the second probe; and wherein formation of the complex creates a functional double-stranded RNA polymerase promoter, one strand of the promoter being provided by the first probe, and the other strand being provided jointly by the sec-ond probe and by the third probe; and a method of detecting a target nucleic acid sequence of interest which method involves the formation of the complex.

L'invention concerne un complexe formé par hybridation et constitué de quatre molécules d'acide nucléique. Ce complexe comprend une molécule d'acide nucléique cible ainsi qu'une première, une deuxième et une troisième molécule sonde d'acide nucléique, la première sonde comprenant une zone de pied complémentaire d'une première partie de la cible, au niveau de laquelle elle est hybridée, et une zone de bras sensiblement non complémentaire de la cible. La deuxième sonde comprend une zone de pied complémentaire d'une seconde partie de la cible. Ainsi, la zone de pied de la deuxième sonde s'hybride avec la cible adjacente ou sensiblement adjacente à la zone de pied de la première sonde, la deuxième sonde comprenant également une zone de bras sensiblement non complémentaire de la cible, mais complémentaire de la zone de bras de la première sonde et hybridée avec cette dernière. La troisième sonde est au moins partiellement complémentaire d'une partie de la zone de bras de manière à s'hybrider avec la zone de bras de la première sonde adjacente ou sensiblement adjacente à la deuxième sonde, la formation dudit complexe permettant de produire un promoteur d'ARN polymérase bicaténaire dont un brin est produit par la première sonde, l'autre brin étant conjointement produit par la deuxième sonde et la troisième sonde. L'invention concerne également une méthode de détection d'une séquence d'acide nucléique d'intérêt impliquant la formation dudit complexe.

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