C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q
Patent
C - Chemistry, Metallurgy
12
Q
C12Q 1/68 (2006.01)
Patent
CA 2373290
Use of the ssrA gene or tmRNA, an RNA transcript of the ssrA gene, or fragments thereof as target regions in a nucleic acid probe assay for the detection and identification of prokaryotic and/or eukaryotic organisms is described. Nucleotide sequence alignment of tmRNA sequences from various organisms can be used to identify regions of homology and non-homology within the sequences which in turn can be used to design both genus specific and species specific oligonucleotide probes. These newly identified regions of homology and non-homology provide the basis of identifying and detecting organisms at the molecular level. Oligonucleotide probes identified in this way can be used to detect tmRNA in samples thereby giving an indication of the viability of non-viral organisms present in various sample types.
La présente invention concerne l'utilisation du gène ssrA ou de l'ARNtm, un transcrit d'ARN du gène ssrA, ou des fragments de ceux-ci en tant que régions cibles dans un dosage d'acides nucléiques par sonde pour la détection et l'identification d'organismes procaryotes et/ou eucaryotes. L'alignement de la séquence nucléotidique des séquences d'ARNtm à partir de divers organismes peut être utilisé pour identifier des régions d'homologie et de non homologie au sein des séquences qui à leur tour peuvent être utilisées pour produire des sondes qui soient à la fois spécifique de genre et spécifique d'espèce. Ces régions d'homologie et de non homologie nouvellement identifiées fournissent la base d'identification et de détection d'organismes au niveau moléculaire. Les sondes oligonucléotidiques ainsi identifiées peuvent être utilisées pour la détection d'ARNtm dans des échantillons procurant ainsi une indication de la viabilité d'organismes non viraux présents dans divers types d'échantillons.
Barry Thomas Gerard
Smith Terence James
Enterprise Ireland (trading As Bioresearch Ireland)
Kirby Eades Gale Baker
National University Of Ireland Galway
LandOfFree
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