Synthesis of polynucleotides having random sequences

C - Chemistry – Metallurgy – 07 – H

Patent

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Details

C07H 21/00 (2006.01)

Patent

CA 2306762

Subject of this invention is a process for the chemical synthesis of polynucleotides having totally or partially random sequences, based on the utilization, as synthesis monomer units for the random sequence part, or presynthetized mononucleotides and dinucleotides. Said synthesis is carried out on separate supports, so that on each of those supports is alternated at least one reaction cycle wherein a mixture of said dinucleotides is bound, with at least one reaction cycle wherein a mononucleotide is bound, and that in a preferred embodiment at the end of the n cycles required for a colon synthesis, the supports are mixed and then redivided into one or more reaction containers. The resulting polynucleotides are such that, for the random sequence part, each trinucleotide unit is fit to match only a limited number of colons, predefined for each unity in number and sequence, and the genetic code degeneracy effects can thus be eliminated. Figure 1 shows the chemical structure of the dinucleotides utilized as monomer units for the synthesis of colons forming the final sequence.

Cette invention a pour objet un procédé de synthèse chimique de polynucléotides comprenant des séquences totalement ou partiellement aléatoires, ce procédé utilisant, comme unités monomères de synthèse pour la partie des séquences aléatoires, des mononucléotides et des dinucléotides préalablement synthétisés. Cette opération de synthèse s'effectue sur des supports séparés, pour que, sur chacun de ces supports, soient exécutés au moins un cycle de réaction entraînant la liaison d'un mélange de ces dinucléotides et au moins un cycle de réaction entraînant la liaison d'un mononucléotide, et, dans un mode de réalisation préféré, à la fin des n cycles nécessaires pour une synthèse de codons, les supports sont mélangés et ensuite redivisés en un ou plusieurs récipients de réaction. Les polynucléotides qui en résultent sont tels que, pour la partie des séquences aléatoires, chaque unité trinucléotide est adaptée de façon à n'entrer en correspondance qu'avec un nombre limité de codons, prédéfinis pour chaque unité en nombre et en séquence, et les effets de dégénérescence du code génétique peuvent ainsi être éliminés. La figure 1 représente la structure chimique des dinucléotides utilisés comme unités monomères pour la synthèse des codons formant la séquence finale.

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Profile ID: LFCA-PAI-O-1601262

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