C - Chemistry – Metallurgy – 07 – H
Patent
C - Chemistry, Metallurgy
07
H
C07H 21/04 (2006.01) C07H 21/00 (2006.01) C12P 19/34 (2006.01) C12Q 1/68 (2006.01)
Patent
CA 2734514
This invention concerns self-avoiding molecular recognition systems (SAMRS), DNA-like molecules that that bind to natural DNA having a Watson-Crick complementary sequence, but do not bind to other SAMRS-containing oligonu-cleotide analogs when SAMRS components are paired with other SAMRS components and, where once bound, serve as primers for polymerase extension, as well as templates in reverse priming characteristic of the polymerase chain reaction. As a product of extensive experimentation, SAMRS building blocks are disclosed that confer these properties on oligonucleotides that contain them, positions in primers where SAMRS building blocks are preferably placed, and a critical mass of biophysical data to support heuristic rules to permit design of SAMRS component-containing sequences that can be used as primers in primer extension and PCR reactions. Also disclosed are compositions containing a plurality of these oligonucleotides that can be used in kits, and pro-cesses using these compositions to PCR amplify target oligonucleotides.
Cette invention concerne des systèmes de reconnaissance moléculaire à évitement automatique (SAMRS), des molécules analogues de l'ADN qui se lient à de l'ADN naturel ayant une séquence complémentaire Watson-Crick, mais ne se lient pas à d'autres analogues oligonucléotidiques contenant SAMRS lorsque des composants SAMRS sont appariés à d'autres composants SAMRS et, une fois liés, servent d'amorces pour une extension par polymérase, ainsi que de modèles dans un amorçage inverse caractéristique de la réaction en chaîne par polymérase. En tant que produit d'expérimentation extensive, l'invention décrit des blocs de construction SAMRS qui confèrent ces propriétés à des oligonucléotides qui les contiennent, des positions dans des amorces dans lesquelles des blocs de construction SAMRS sont de préférence placés, et une masse critique de données biophysiques pour accueillir des règles heuristiques pour permettre la conception de séquences contenant un composant SAMRS, qui peuvent être utilisées en tant qu'amorces dans des réactions d'extension d'amorce et de PCR. L'invention concerne également des compositions contenant une pluralité de ces oligonucléotides qui peuvent être utilisés dans des kits, ainsi que des procédés d'utilisation de ces compositions pour amplifier par PCR des oligonucléotides cibles.
Benner Steven Albert
Chen Fei
Hoshika Shuichi
Benner Steven Albert
Chen Fei
Hoshika Shuichi
Mbm Intellectual Property Law Llp
LandOfFree
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Profile ID: LFCA-PAI-O-1602406