Modified microbial nucleic acid for use in detection and...

C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q

Patent

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Details

C12Q 1/68 (2006.01)

Patent

CA 2654010

The present invention provides derivatives or modified nucleic acid sequences of several microorganisms for use in the detection and analysis of said microorganisms. The derivative nucleic acids contain the bases adenosine (A), guanosine (G), T (thymine) and U (uracil or some other non-A, G or T base or base-like entity). Given that microbial nucleic acids do not contain methylated cytosine (C) or other C alterations, all C are converted to U. These sequences are amplified where the U in the derivative nucleic acid is replaced by a T, resulting in a modified sequence with the same number of total bases as the corresponding unmodified microbial nucleic acid sequence but made up of a combination of three bases only: A, G and T. As a consequence of this process the nucleic acids derived from the upper and lower strands of the original dsDNA are no longer complementary and the modified microbial sequences have reduced relative genomic complexity for use in detection and analysis of microorganisms.

La présente invention concerne des séquences d'acides nucléiques dérivés ou modifiés de plusieurs micro-organismes, destinés à être utilisés dans la détection et dans l'analyse desdits micro-organismes. Les acides nucléiques dérivés contiennent les bases A (adénosine), G (guanosine), T (thymine) et U (uracile ou une autre base ou entité analogue à une base différente de A, G ou T). Étant donné que les acides nucléiques microbiens ne contiennent pas de cytosine (C) méthylée ou d'autres modifications de C, toutes les C sont converties en U. Ces séquences sont amplifiées là où l'U dans l'acide nucléique dérivé est remplacé par une T, donnant une séquence modifiée qui a le même nombre total de bases que la séquence correspondante de l'acide nucléique microbien non modifié mais qui est constituée d'une combinaison de trois bases seulement : A, G et T. Par suite de ce processus, les acides nucléiques dérivés des brins supérieur et inférieur de l'ADN double brin d'origine ne sont plus complémentaires et les séquences microbiennes modifiées ont une complexité génomique relative réduite servant à la détection et l'analyse de micro-organismes.

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