Selection of genotyped transfusion donors by cross-matching...

G - Physics – 06 – F

Patent

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G06F 19/18 (2011.01)

Patent

CA 2627013

Disclosed are methods for establishing the compatibility between two blood types on the basis of cross-matching (under a designated rule of stringency) the minor blood group genotypes of recipient and prospective donors. To determine compatibility, the blood group genotypes are mapped to corresponding phenotypes according to the expression states associated with a set of underlying haplotypes, and compatibility is established by establishing the compatibility of blood types constructed as a combination of constituent phenotypes. The bit strings are matched, preferably using an algorithm expression. Where ambiguity in mapping genotypes to haplotypes exists, it can be reduced based on frequency of occurrence of the haplotypes in the sample population, or resolved by gametic phasing. Such reduction or resolution of ambiguity is particularly desirable where mismatches in the antigens expressed by the constituent haplotypes have greater clinical significance.

L'invention porte sur des procédés qui permettent d'établir la compatibilité entre deux types sanguins sur la base d'une épreuve de compatibilité croisée (conformément à une règle de stringence désignée) entre les génotypes de groupe sanguin mineurs du receveur et des donneurs potentiels. Pour déterminer la compatibilité, on met en correspondance les génotypes de groupe sanguin avec les phénotypes correspondants en fonction des états d'expression associés à un ensemble d'halotypes sous-jacents, et on établit la compatibilité en établissant la compatibilité des types sanguins construits comme une combinaison de phénotypes constituants. Les chaînes de bits sont mises en correspondance, de préférence au moyen d'une expression algorithmique. Lorsqu'il y a ambiguïté dans la mise en correspondance des génotypes et des haplotypes, on peut réduire l'ambiguïté sur la base de la fréquence d'occurrence des haplotypes dans la population échantillon, ou la résoudre par le phasage des gamètes. Il est particulièrement souhaitable de procéder à la réduction ou à la résolution de l'ambiguïté lorsque les mésappariements dans les antigènes exprimés par les halotypes constituants possèdent une plus grande importance clinique.

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