Method for providing a canonical structural representation

G - Physics – 06 – F

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G06F 17/00 (2006.01) G06G 7/48 (2006.01)

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CA 2546567

A system and method for representing chemical compounds in a canonical manner that enables one to associate multiple structures, including proto-stereomers, with a compound. The system and method comprising receiving an input representation of a structure of a compound (302), neutralize acidic and basic atoms in the structure (312), remove chiral specifications associated with invertible and proto-invertible centers of the structure (315), and identify various neutral protomers (316) of the compound based on tautomeric transforms applied based upon heuristic rules or any set of rules. The neutral protomers can be canonically ranked (318) and one of the neutral protomers can be selected as a canonically unique protomer for the compound (320).

La présente invention concerne des modes de réalisation relatifs à un système et à un procédé de représentation de composés chimiques de manière canonique permettant d'associer de multiples structures, y compris des proto-stéréomères, avec un composé. On prévoit une représentation de saisie d'une structure d'un composé, la neutralisation d'atomes acides et basiques dans la structure, le retrait de spécification chirale associées à des centres réversibles et protoréversibles de la structure, l'identification de différents protomères neutres du composé d'après les transformations tautomériques appliquées selon les règles heuristiques ou d'autres moyens d'évaluation de la plausibilité de protomères ou d'après un ensemble quelconque de règles. Les protomères neutres peuvent être rangés de manière canonique et un des protomères neutres peut être sélectionné comme protomère unique canonique pour le composé. La génération d'une représentation du protomère unique canonique permet la représentation du composé et son identification de manière canonique.

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