C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q
Patent
C - Chemistry, Metallurgy
12
Q
C12Q 1/68 (2006.01)
Patent
CA 2387148
The invention relates to a method for distinguishing 5-position methylation changes of cytosine bases and cytosine-to-thymine mutations and for detecting single nucleotide polymorphisms (SNPs) or point mutations in genomic DNA, comprising the following steps: a) treating a genomic DNA-sample with sulphite or disulphite in such a way that all of the cytosine bases not methylated in the 5-position of the base are changed in such a way as to produce a different base according to the base pairing behaviour while the cytosines which are methylated in the 5-position remain unchanged; b) quantitatively methylating an aliquot of the same genomic DNA sample before chemical treatment according to a) with Sss1 or another methyltransferase; c) testing the two DNA samples treated in this way for the presence of cytosine using the same analytical methods; and d) comparing the cytosine positions that are detected with a reference DNA-sequence.
L'invention concerne un procédé permettant de distinguer les modifications de méthylation en position 5 de bases de cytosine et les mutations de cytosine en thymine et permettant de détecter des polymorphismes simple nucléotide (PSN) ou des mutations ponctuelles dans un échantillon d'ADN génomique. Ce procédé consiste a) à traiter un échantillon d'ADN génomique au sulfite ou disulfite de telle façon que toutes les bases de cytosine non méthylées en position 5 soient modifiées telle manière que l'on obtienne une base différente en termes de comportement d'appariement de bases, tandis que la cytosine méthylée en position 5 demeure intacte ; b) à méthyler quantitativement une partie aliquote de cet échantillon d'ADN génomique avant le traitement chimique a) avec Sss1 ou une autre méthyle transférase ; c) à déterminer la présence de cytosine dans les deux échantillons d'ADN ainsi traités par la même méthode d'analyse et d) à comparer les positions de la cytosine détectées avec la séquence d'ADN de référence.
Epigenomics Ag
Macrae & Co.
LandOfFree
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Profile ID: LFCA-PAI-O-1716722