G - Physics – 01 – N
Patent
G - Physics
01
N
G01N 33/68 (2006.01) G01N 33/53 (2006.01)
Patent
CA 2319828
The present invention provides high-density arrays comprising a primary protein array and a secondary antibody array, wherein the secondary array comprises monoclonal antibodies and/or antibody variants or derivatives that bind specifically or non-specifically to one or more proteins in the primary array, and wherein the secondary array is used to determine the protein profile of a cell, tissue, organ or whole organism or a cellular extract, lysate or protein fraction derived therefrom. Also provided are methods of determining the epitope profile of cells, tissues, organs and whole organisms and cellular extracts, lysates or protein fractions derived therefrom, using the high density protein arrays of the invention, in particular in relation to diagnostic and therapeutic applications. The invention further provides for the enrichment of native proteins from complex mixtures of cellular proteins by employing one or more antibodies uniquely recognising an antigen of interest as defined by recognition patterns obtained when screening secondary antibody arrays against primary antigen arrays. In addition, one or more antibodies can be employed to produce a unique tag for target antigens and is employed to follow the expression levels of complex mixtures of cellular proteins and is conducted independently of the separation sciences. A similar approach is employed to produce a fingerprint of a biological sample, based upon recognition of a multiplicity of individual antigens providing a pattern useful in recognition or diagnosis of a group of biological samples of interest in healthy and diseased samples, or test and control experimental situations for diagnostic purposes.
La présente invention concerne des séries haute densité comprenant un série primaire de protéines et une série secondaire d'anticorps. Cette série secondaire comprend des anticorps monoclonaux et/ou des variantes d'anticorps ou des dérivés qui se lient de manière spécifique ou non spécifique à une ou plusieurs protéines dans la série primaire, et où la série secondaire permet de déterminer le profil protéique d'une cellule, d'un tissu, d'un organe ou de la totalité d'un organisme ou d'un extrait cellulaire, d'un lysat ou d'une fraction protéique dérivée de ce dernier. L'invention traite également de procédés permettant de déterminer le profil épitopique de cellules, tissus, organes et de la totalité d'organismes et d'extraits cellulaires, de lysats ou de fractions protéiques dérivés de ces derniers, à l'aide des séries de protéines haute densité selon l'invention, en particulier, en ce qui concerne leurs applications diagnostiques et thérapeutiques. L'invention traite également de l'enrichissement de protéines natives à partir de mélanges complexes de protéines cellulaires en utilisant un ou plusieurs anticorps reconnaissant uniquement un antigène présentant un intérêt particulier, tel que défini par les schémas de reconnaissance obtenus lors de l'analyse des séries d'anticorps secondaires par rapport aux séries d'antigènes primaires; En outre, un ou plusieurs anticorps peuvent être utilisés pour produire un marqueur unique pour des antigènes cibles et sont utilisés pour suivre les niveaux d'expression des mélanges complexes de protéines cellulaires et sont mis en oeuvre indépendamment des sciences de séparation. Une approche semblable est utilisée pour produire une empreinte d'un échantillon biologique, en se fondant sur la reconnaissance d'une multiplicité d'antigènes individuels qui constitue un schéma utile pour reconnaître ou diagnostiquer un groupe d'échantillons biologiques présentant un intérêt particulier dans les échantillons sains et malades, ou dans des situations expérimentales témoins ou de tests pour des applications diagnostiques.
Comino John Nicholas
Fetherstonhaugh & Co.
Glaucus Proteomics B.v.
Humphery-Smith Ian
Miller Samuel
LandOfFree
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