Process for generation of protein and uses thereof

Details Process for generation of protein and uses thereof Process for generation of protein and uses thereof

C - Chemistry, Metallurgy

07

K

C07K 1/00 (2006.01) C07H 21/04 (2006.01) C07K 14/415 (2006.01) C12N 15/29 (2006.01) C12N 15/64 (2006.01)

Patent

CA 2665766

A method of generating a protein with an improved functional property, the method comprising: (a) identifying at least one Target amino acid Residue in a first protein, wherein said Target amino acid Residue is associated with said functional property; (b) comparing at least one homologous second protein from the same or a different phylogenetic branch as the first protein with the first protein and identifying at least one Variant amino acid Residue between the first protein and the second protein; (c) selecting at least one Candidate amino acid Residue from the Variant amino acid Residue identified in (b) on the basis of said Candidate amino acid Residue affecting said Target amino acid Residue with respect to said functional property; (d) forming at least one Candidate Mutant protein in silico or producing at least one Candidate Mutant protein in vitro in which said at least one Candidate amino acid Residue from the second protein substitutes a corresponding residue in the first protein; and (e) screening said at least one Candidate Mutant protein produced in (d) to identify a protein having said improved functional property.

Procédé de formation d'une protéine ayant une propriété fonctionnelle améliorée, le procédé consistant à : (a) identifier au moins un résidu d'acide aminé cible dans une première protéine, ledit résidu d'acide aminé cible étant associé à ladite propriété fonctionnelle ; (b) comparer la première protéine avec au moins une seconde protéine homologue provenant de la même branche phylogénétique ou d'une branche phylogénétique différente que la première protéine et identifier au moins un résidu d'acide aminé variant entre la première protéine et la seconde protéine ; (c) sélectionner au moins un résidu d'acide aminé candidat à partir du résidu d'acide aminé variant identifié en (b) sur la base du fait que ledit résidu d'acide aminé candidat affecte ledit résidu d'acide aminé cible en ce qui concerne ladite propriété fonctionnelle ; (d) former au moins une protéine mutante candidate in silico ou produire au moins une protéine mutante candidate in vitro, dans laquelle ledit ou lesdits résidus d'acide aminé candidats provenant de la seconde protéine remplacent un résidu correspondant dans la première protéine ; et (e) cribler ladite ou lesdites protéines mutantes candidates produites en (d) pour identifier une protéine ayant ladite propriété fonctionnelle améliorée.

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