C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q
Patent
C - Chemistry, Metallurgy
12
Q
C12Q 1/70 (2006.01)
Patent
CA 2365870
The present invention discloses a method for detecting the presence of an enterovirus in a clinical sample. The invention additionally discloses a method for typing an enterovirus in a clinical sample. Both methods employ a set of primer oligonucleotides for reverse transcription and amplification that hybridize to conserved regions of the enterovirus genome, and that provide amplicons that include significant portions of the VP1 region that are characteristic of the various serotypes. In the typing method, the invention further provides a database consisting of nucleotide sequences from prototypical enteroviral serotypes, which is used to type the clinical sample by comparing the sequence of its amplicon with each prototypical sequence in the database. The invention additionally provides mixtures of primer oligonucleotides, and a kit for use in conducting the typing method that includes a mixture of the primer oligonucleotides.
L'invention concerne une méthode permettant de détecter la présence d'un entérovirus dans un spécimen clinique. L'invention concerne également une méthode permettant de déterminer le type d'un entérovirus dans un spécimen clinique. Ces deux méthodes emploient une série d'oligonucléotides d'amorçage pour obtenir une transcription inverse et une amplification qui s'hybrident à des régions conservées du génome de l'entérovirus et qui produisent des amplicons comprenant des parties importantes de la région VP1 qui sont caractéristiques des différents sérotypes. Pour ce qui est de la méthode de typage, l'invention concerne également une base de données constituée de séquences nucléotidiques tirées de sérotypes entéroviraux prototypiques, laquelle base de données sert à déterminer le type du spécimen clinique en comparant la séquence de son amplicon avec chaque séquence prototypique de la base de données. L'invention concerne en outre des mélanges d'oligonucléotides d'amorçage ainsi qu'une trousse servant à réaliser la méthode de typage et comprenant un mélange d'oligonucléotides d'amorçage.
Kilpatrick David R.
Maher Kaija
Oberste Steven
Pallansch Mark A.
Gowling Lafleur Henderson Llp
The Government Of The United States Of America As Represented By
LandOfFree
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Profile ID: LFCA-PAI-O-1762269