Method to screen phage display libraries with different ligands

C - Chemistry – Metallurgy – 12 – N

Patent

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C12N 15/10 (2006.01) C07K 1/04 (2006.01) C07K 14/705 (2006.01) C07K 14/725 (2006.01) C07K 16/00 (2006.01) C12Q 1/68 (2006.01) G01N 33/68 (2006.01)

Patent

CA 2308791

The invention provides a method for selecting, from a repertoire of polypeptides, a population of functional polypeptides which bind a target ligand in a first binding site and a generic ligand in a second binding site, which generic ligand is capable of binding functional members of the repertoire regardless of target ligand specificity, comprising the steps of. a) contacting the repertoire with the generic ligand and selecting functional polypeptides bound thereto; and b) contacting the selected functional polypeptides with the target ligand and selecting a population of polypeptides which bind to the target ligand. The invention accordingly provides a method by which a polypeptide repertoire is preselected, according to functionality as determined by the ability to bind the generic ligand, and the subset of polypeptides obtained as a result of such preselection is then employed for further selection according to the ability to bind the target ligand.

Dans la présente invention, on divulgue une méthode pour sélectionner, dans un répertoire de polypeptides, une population de polypeptides fonctionnels qui lie un ligand cible à un premier site de liaison et un ligand générique à un second site de liaison, le ligand générique étant capable de lier des membres fonctionnels du répertoire quelle que soit la spécificité du ligand cible. La présente méthode comprend les étapes suivantes : a) mettre en contact le répertoire avec le ligand générique et sélectionner des polypeptides fonctionnels qui s'y lient; b) mettre en contact les polypeptides fonctionnels sélectionnés avec le ligand cible et sélectionner une population de polypeptides qui se lient à ce ligand cible. La présente invention fournit donc une méthode permettant de présélectionner un répertoire de polypeptides, en fonction de la fonctionnalité déterminée par la capacité à se lier au le ligand générique, et d'employer le sous-ensemble de polypeptides ainsi obtenus lors d'une telle présélection pour une sélection ultérieure en fonction de la capacité à se lier au ligand cible.

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