C - Chemistry – Metallurgy – 12 – N
Patent
C - Chemistry, Metallurgy
12
N
C12N 15/09 (2006.01) C12Q 1/68 (2006.01)
Patent
CA 2671210
In amplifying a region containing two allelic genes, the polymorphism of one of the allelic genes is positioned at or near the 3' end of an amplification primer, so that the chain would extend only from one of the two primers, one that matches the mutant type nucleotide(s) and one that matches the wild-type nucleotide(s). The other primer is unaffected by the allelic genes but is positioned to include the other allelic gene in the amplicon. The PCR amplifies only the target genomic DNA having one specific allele of the first allelic gene. The technique exploits the fact that the haplotype of the first and the second allelic genes can be determined if the allele of the second allelic gene in the amplicon can be identified. Designing probes with complementary sequences for identifying the two alleles (major and minor) of the second allelic gene, and fixing the probe set on a solid support and hybridizing them with the amplicon to identify the probe that forms a hybrid, are characteristic features of the present invention.
Lors de l'amplification d'une région contenant deux gènes allèliques, le polymorphisme de l'un de ces gènes allèliques est positionné en extrémité 3'ou près de cette extrémité d'une amorce d'amplification, de sorte que la chaîne s'étende uniquement à partir d'une ou de deux amorces, une qui correspond au(x) nucléotide(s) de type mutant et une qui correspond au(x) nucléotide(s) de type sauvage. L'autre amorce n'est pas affectée par les gènes allèliques mais est positionnée de façon à inclure l'autre gène allèlique dans l'amplicon. La PCR amplifie uniquement l'ADN génomique cible possédant un allèle spécifique du premier gène allèlique. La technique exploite le fait que l'haplotype du premier et du second gène allèlique peut être déterminé si l'allèle du second gène allèlique dans l'amplicon peut être identifié. La conception de sondes avec des séquences complémentaires pour identifier les deux allèles (majeur et mineur) du second gène allèlique, et la fixation de l'ensemble de sondes sur un support solide et l'hybridation de celles-ci avec l'amplicon pour identifier la sonde qui forme un hybride sont des caractéristiques de cette invention.
Mizutani Yuri
Takahama Shin-Ichiro
Canon Kabushiki Kaisha
Ridout & Maybee Llp
LandOfFree
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Profile ID: LFCA-PAI-O-1860826