G - Physics – 05 – B
Patent
G - Physics
05
B
G05B 1/03 (2006.01) C07K 14/47 (2006.01) A61K 38/00 (2006.01)
Patent
CA 2331754
The present invention provides methods for determining the level of protein activity in a cell by: (i) measuring abundances of cellular constituents in a cell in which the activity of a specific protein is to be determined so that a diagnostic profile is thus obtained; (ii) measuring abundances of cellular constituents that occur in a cell in response to perturbations in the activity of said protein to obtain response profiles and interpolating said response profiles to generate response curves; and (iii) determining a protein activity level at which the response profile extracted from the response curves best fits the measured diagnostic profile, according to some objective measure. In alternative embodiments, the present invention also provides methods for identifying individuals having genetic mutations or polymorphisms that disrupt protein activity, and methods for identifying drug activity in vivo by determining the activity levels of proteins which interact with said drugs.
La présente invention concerne des procédés pour déterminer le niveau d'activité d'une protéine dans une cellule. Le procédé consiste à i) mesurer l'abondance de constituants cellulaires dans une cellule dans laquelle l'activité d'une protéine spécifique doit être déterminée de manière à obtenir un profil diagnostique; ii) mesurer l'abondance de constituants cellulaires provoquée dans une cellule par des perturbations survenant dans l'activité de ladite protéine pour obtenir des profils de réponse, et interpoler lesdits profils de réponse pour générer des courbes de réponse; et iii) déterminer un niveau d'activité de la protéine auquel le profil de réponse extrait des courbes de réponse correspond le mieux avec le profil diagnostique mesuré suivant une mesure objective. Dans des formes de réalisation différentes, on décrit des procédés d'identification d'individus présentant des mutations génétiques ou polymorphismes qui perturbent l'activité de la protéine, ainsi que des procédés qui permettent d'identifier l'effet in vivo de médicaments par détermination des niveaux d'activité de protéines en interaction avec lesdits médicaments.
Friend Stephen H.
Stoughton Roland
Osler Hoskin & Harcourt Llp
Rosetta Inpharmatics Inc.
LandOfFree
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Profile ID: LFCA-PAI-O-1895743