Resonance energy transfer assay with cleavage sequence and...

C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q

Patent

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Details

C12Q 1/37 (2006.01) G01N 21/64 (2006.01) G01N 33/52 (2006.01)

Patent

CA 2699612

A molecular construct comprises a donor label, an acceptor label, a linker peptide disposed between the donor and the acceptor, the linker having a cleavage site sequence, and a spacer between at least one of (a) the donor and the cleavage site sequence and (b) the acceptor and the cleavage site sequence. Preferably, the construct is selected from the group consisting of CFP-(SGLRSRA)-SNAP-25-(SNS)- YFP, and CFP-(SGLRSRA)-synap- tobrevin-(SNS)-YFP. In preferred embodiments, the linker peptide is a substrate of a botulinum neurotoxin selected from the group consisting of synaptobrevin (VAMP), syntaxin and SNAP-25, or a fragment thereof that can be recognized and cleaved by the botulinum neurotoxin. Advantageously, the spacer increases the electronic coupling between the donor label and the acceptor label relative to a corresponding construct without the spacer.

Selon l'invention, une construction moléculaire comprend une étiquette donneur, une étiquette accepteur, un groupe de liaison peptidique placé entre le donneur et l'accepteur, le groupe de liaison ayant une séquence de site de clivage, et un groupe d'intercalation entre au moins l'un de (a) le donneur et la séquence de site de clivage et b) l'accepteur et la séquence de site de clivage. De préférence, la construction est sélectionnée dans le groupe constitué de CFP-(SGLRSRA)-SNAP-25-(SNS)-YFP et CFP-(SGLRSRA)-synaptobrévine-(SNS)-YFP. Dans des modes de réalisation préférés, le groupe de liaison peptidique est un substrat d'une neurotoxine botulique sélectionné dans le groupe constitué de la synaptobrévine (VAMP), la syntaxine et SNAP-25 ou un fragment de celles-ci qui peut être reconnu et clivé par la neurotoxine botulinique. Avantageusement, le groupe d'intercalation augmente le couplage électronique entre l'étiquette donneur et l'étiquette accepteur par rapport à une construction correspondante sans le groupe d'intercalation.

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