Nucleic acid binding of multi-zinc finger transcription factors

Details Nucleic acid binding of multi-zinc finger transcription factors Nucleic acid binding of multi-zinc finger transcription factors

C - Chemistry, Metallurgy

12

Q

C12Q 1/00 (2006.01) C07K 14/47 (2006.01) C12Q 1/68 (2006.01)

Patent

CA 2370687

The invention concerns a method of identifying transcription factors comprising providing cells with a nucleic acid sequence at least comprising a sequence CACCT as bait for the screening of a library encoding potential transcription factors and performing a specificity test to isolate said factors. Preferably the bait comprises twice the CACCT sequence, more particularly the bait comprises one of the sequences CACCT-N-CACCT, CACCT-N- AGGTG, AGGTG-N-CACCT or AGGTG-N-AGGTG wherein N is a spacer sequence. The identified transcription factor(s) using the method according to the invention comprises separated clusters of zinc fingers such as for example a two-handed zinc finger transcription factor. The present invention further discloses that at least one such zinc finger transcription factor, denominated as SIP1, induces tumor metastasis by downregulation of the expression of E-cadherin. Compounds interfering with SIP1 activity can thus be used to prevent tumor invasion and metastasis.

L'invention concerne un procédé d'identification de facteurs de transcription permettant d'apporter à des cellules une séquence d'acide nucléique comprenant au moins une séquence CACCT comme appât dans le criblage d'une bibliothèque codant les facteurs de transcription potentiels et exécutant un test spécifique pour éliminer ces facteurs. L'appât comprend, de préférence, deux séquence CACCT, plus particulièrement, l'appât comprend une des séquences CACCT-N-CACCT, CACCT-N-AGGTG, AGGTG-N-CACCT ou AGGTG-N-AGGTG dans lesquelles N représente une séquence d'espacement. Le(s) facteur(s) de transcription identifié(s) utilisant le procédé de l'invention comprend (comprennent) des groupes séparés de doigts de zinc tels que par exemple un facteur de transcription de doigt de zinc à deux mains. En outre, la présente invention indique qu'au moins un facteur de transcription de doigt de zinc, appelé SIP1, provoque des métastases tumorales par régulation à la baisse de l'expression de E-cadhérine. Les composés interférants avec l'activité SIP1 peuvent ainsi être utilisés pour empêcher l'invasion de tumeurs et la métastase.

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