C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q
Patent
C - Chemistry, Metallurgy
12
Q
C12Q 1/68 (2006.01)
Patent
CA 2402320
The method of the invention comprises the stratification of a cancer patient population into various cancer therapy groups based on analysis by genomic DNA microarray of multiple gene amplifications or deletions present or absent in the diseased tissue of each patient. In particular, the invention involves patient stratification into one of at least four cancer therapy groups based on the microarray analysis of gene amplification or gene deletion at multiple chromosome locations. The invention has the significant clinical advantage of guiding selection of expensive cancer adjuvant drugs for use with patients most likely to respond positively to the individual drug. For example, a genomic DNA microarray simultaneously measuring 59 separate gene amplifications or gene deletions in diseased tissue can be used to stratify solid tumor cancer patients, such as breast cancer patients, into at least nine groups: those most likely to respond to (i) anti-HER-2/neu therapy (Herceptin®), (ii) anti-EGFR therapy (C225 antibody), (iii) anti-AKT1 therapy (cis-platin), (iv) anti-PIK3CA therapy, (v) anti-thymidylates synthase therapy (5-fluorouracil), (iv) anti-Topoisomerase II therapy (doxorubicin), (vii) anti-cmyc therapy, (viii) combination of anti-HER-2 therapy and anti- AKT1 therapy, and (ix) combination of anti-EGFR and anti-AKT1 therapy. The invention has the further advantage of identifying patients most likely to respond synergistically to a particular combination of adjuvant therapies.
L'invention comprend la stratification d'une population de patients souffrant du cancer visant à définir plusieurs groupes de thérapie du cancer sur la base de l'analyse de micro-réseaux d'ADN génomique présentant des amplifications et des délétions multiples de gènes, présentes ou absentes dans le tissu malade du patient. L'invention concerne notamment la stratification des patients en au moins quatre groupes de thérapie du cancer sur la base de l'analyse de micro-réseaux d'amplifications et de délétions de gènes dans plusieurs sites de chromosomes. L'invention présente un avantage clinique important en ce qu'elle permet d'orienter la sélection de médicaments auxiliaires onéreux, dirigés contre le cancer, vers les patients qui présentent la plus forte probabilité de réagir positivement à ce médicament individuel. Ainsi, un micro-réseau d'ADN génomique présentant simultanément 59 amplifications ou délétions de gènes dans un tissu malade peut être utilisé pour stratifier des patients à tumeurs cancéreuses solides tels que les patientes souffrant du cancer du sein en au moins neuf groupes: celles qui réagissent avec le plus de probabilité à (1) une thérapie anti-HER-2/neu (Herceptine®), (2) une thérapie anti-EGFR (anticorps C225), (3) une thérapie anti-AKT1 (cis-platine), (4) une thérapie anti-PIK3CA, (5) une thérapie anti-thymidylate synthase (5-fluorouracil), (6) une thérapie anti-topoisomérase II (doxorubicine), (7) une thérapie anti-cmyc, (8) une combinaison des thérapies anti-HER-2 et anti-AKT1 et (9) une combinaison des thérapies anti-EGFR et anti-AKT1. L'invention présente l'avantage supplémentaire de permettre l'identification des patients qui présentent la plus grande probabilité de réponse synergique à une combinaison particulière de thérapies auxiliaires.
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