Heteroduplex tracking assay

Details Heteroduplex tracking assay Heteroduplex tracking assay

C - Chemistry, Metallurgy

12

Q

C12Q 1/68 (2006.01) C12Q 1/70 (2006.01) G01N 33/53 (2006.01) C07K 14/715 (2006.01)

Patent

CA 2637600

A change in viral tropism occurs in many HIV positive individuals over time and may be indicated by a shift in coreceptor use from CCR5 to CXCR4. The shift in coreceptor use to CXCR4 has been shown to correlate with increased disease progression. In patients undergoing HAART, the predominant populations of virus may be shifted back to CCR5- mediated entry soon after the CXCR4- specific strains have emerged. The present invention relates to a diagnostic method to monitor coreceptor use in the treatment and clinical management of human immunodeficiency virus (HIV) infection. The present invention further relates to a diagnostic method applied to HIV-positive individuals undergoing HAART to monitor the suppression of CCR5- or CXCR4-specific strains. The diagnostic methods may be used to assist in selecting antiretroviral therapy and to improve predictions of disease prognosis over time. The methods of the invention include cell-based methods, including cell fusion assays, and molecular-based methods, including heteroduplex tracking assay, to both quantitatively and qualitatively analyze patient-derived HIV for coreceptor usage.

Chez beaucoup de malades VIH positifs, une modification du tropisme viral, qui se produit dans le temps peut se traduire par un déplacement de l~utilisation du co-récepteur du CCR5 vers le CXCR4. Ce déplacement vers le CXCR4 s~est avéré en corrélation avec une progression accrue de la maladie. Chez les patients sous HAART, les populations prédominantes de virus peuvent régresser vers les entrées médiées par le CCR5 dès l~apparition des souches spécifiques du CXCR4. L'invention porte sur des méthodes de diagnostic suivant l~utilisation du co-récepteur dans le traitement et la gestion clinique de l~infection par le VIH, et sur des méthodes de diagnostic s~appliquant aux malades VIH positifs sous HAART pour supprimer les souches spécifiques traitement CCR5 ou CXCR4. Les méthodes diagnostiques peuvent aider à sélectionner des thérapies antirétrovirales et à améliorer les prévisions de pronostiques de maladies. Les méthodes de l~invention comprennent des méthodes à base de cellules dont des bioessais de fusion de cellules et des méthodes à base de molécules dont des bioessais de suivi en hétéroduplex, présentant à la fois une analyse quantitative et qualitative du VIH d~un patient relative à l~utilisation d~un co-récepteur.

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