Probe/mobility modifier complexes for multiplex nucleic acid...

C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q

Patent

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Details

C12Q 1/68 (2006.01) C07H 21/00 (2006.01)

Patent

CA 2365125

Compositions and methods for the analysis of multiple nucleic acid target sequences are disclosed. The compositions comprise a probe comprising a target- specific portion for sequence-specific hybridization to a target nucleic acid sequence, and a tag; and a mobility-modifier comprising a tail and a tag complement for binding to the tag. The associated methods generally comprise the steps of providing a sample potentially containing one or more target nucleic acid sequences; providing one or more probes, each probe comprising a target-specific portion and a tag; providing one or more mobility modifiers, each mobility modifier comprising a tag complement and a tail; contacting the probe(s) and the target nucleic acid sequence(s) under conditions effective for sequence-dependent hybridization of the probe(s) and the target nucleic acid sequence(s); contacting the probe(s) and the mobility-modifier(s) under conditions suitable for selectively binding the probe(s) to the mobility modifier(s), thereby forming one or more probe/mobility modifier complex(s); and analyzing the probe/mobility modifier complex(s) using a mobility- dependent analysis technique.

L'invention concerne des compositions et des méthodes permettant d'analyser de multiples séquences d'acide nucléique cibles. Les compositions de cette invention renferment une sonde comprenant une partie spécifique d'une cible permettant une hybridation spécifique d'une séquence avec une séquence d'acide nucléique cible, ainsi qu'un marqueur. Par ailleurs, un modificateur de mobilité présente une extrémité et un complément de marqueur destiné à se lier à cette extrémité. Les méthodes associées consistent tout d'abord à prendre un échantillon contenant potentiellement une ou plusieurs séquences d'acide nucléique, à prendre une ou plusieurs sondes, chacune de ces sondes renfermant une partie spécifique d'une cible et un marqueur, et à prendre un ou plusieurs modificateurs de mobilité qui présentent chacun un complément de marqueur et une extrémité. Ces méthodes consistent ensuite à mettre en présence la(les) sonde(s) et la(les) séquence(s) d'acide nucléique dans des conditions permettant une hybridation, dépendante de la(des) séquence(s), de la(des) sonde(s) avec la(des) séquence(s) d'acide nucléique. Puis ces méthodes consistent à mettre en présence la(les) sonde(s) et le(s) modificateur(s) de mobilité dans des conditions permettant une liaison sélective de cette(ces) sonde(s) à ce(s) modificateur(s) de mobilité, afin de former un ou plusieurs complexe(s) sonde/modificateur de mobilité. Ces méthodes consistent enfin à analyser ce(s) complexe(s) sonde/modificateur de mobilité selon une technique d'analyse dépendante de la mobilité.

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