New sequences of hepatitis c virus genotypes and their use...

C - Chemistry – Metallurgy – 12 – N

Patent

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C12N 15/51 (2006.01) A61K 38/08 (2006.01) A61K 38/10 (2006.01) A61K 39/29 (2006.01) C07H 21/00 (2006.01) C07K 7/06 (2006.01) C07K 7/08 (2006.01) C07K 14/18 (2006.01) C07K 16/10 (2006.01) C12N 15/11 (2006.01) C12Q 1/68 (2006.01) C12Q 1/70 (2006.01) G01N 33/543 (2006.01) G01N 33/576 (2006.01)

Patent

CA 2201703

The present invention relates to new genomic nucleotide sequences and amino acid sequences corresponding to the coding region of these genomes. The invention relates to new HCV types and subtypes sequences which are different from the known HCV types and subtypes sequences. More particularly, the present invention relates to new HCV type 7 sequences, new HCV type 9 sequences, new HCV type 10 and new HCV type 11 sequences. Also, the present invention relates to new HCV type 1 sequences of subtypes 1d, 1e, 1f and 1g; new HCV type 2 sequences of subtypes 2e, 2f, 2g, 2h, 2i, 2k and 2l; new HCV type 3 sequences of subtype 3g, new HCV type 4 sequences of subtypes 4k, 4l and 4m; a process for preparing them, and their use for diagnosis, prophylaxis and therapy. More particularly, the present invention provides new type- specific sequences of the Core, the E1 and the NS5 regions of new HCV types 7, 9, 10 and 11, as well as of new variants (subtypes) of HCV types 1, 2, 3 and 4. These new HCV sequences are useful to diagnose the presence of HCV type 1, and/or type 2, and/or type 3, and/or type 4, and/or type 7, and/or type 9, and/or type 10, and/or type 11 genotypes or serotypes in a biological sample. Moreover, the availability of these new type-specific sequences can increase the overall sensitivity of HCV detection and should also prove to be useful for prophylactic and therapeutic purposes.

L'invention concerne de nouvelles séquences génomiques de nucléotides et d'acides aminés correspondant à la région codante de ces génomes. L'invention concerne également des séquences nouvelles de types et de sous-types du virus de l'hépatite C, lesquelles sont différentes des séquences connues de types et de sous-types de ce virus. L'invention concerne plus particulièrement des séquences nouvelles de type 7, type 9, type 10 et type 11 de ce virus. L'invention concerne encore des séquences nouvelles des sous-types 1d, 1e, 1f et 1g du type 1 dudit virus VHC; des séquences nouvelles des sous-types 2e, 2f, 2g, 2h, 2i, 2k et 2l du type 2 dudit virus VHC; des séquences nouvelles du sous-type 3g du type 3 du VHC, des séquences nouvelles des sous-types 4k, 4l et 4m du type 4 du VHC; ainsi qu'un procédé de préparation de ces séquences et l'utilisation de celles-ci à des fins diagnostiques, prophylactiques et thérapeutiques. En outre, l'invention concerne des séquences nouvelles spécifiques à des types, des régions du noyau, et les régions E1 et NS5 des types nouveaux 7, 9, 10 et 11 du VHC, ainsi que de nouveaux (sous-types) des types 1, 2, 3 et 4 du virus VHC. Ces nouvelles séquences du virus de l'hépatite C sont utiles pour diagnostiquer, dans un échantillon biologique, la présence de génotypes ou sérotypes du type 1, et/ou du type 2, et/ou du type 3, et/ou du type 4, et/ou du type 7, et/ou du type 9, et/ou du type 10, et/ou du type 11 du VHC. En outre, grâce à ces nouvelles séquences disponibles, spécifiques à des types, on peut améliorer le taux global de détection du virus de l'hépatite C, lesdites séquences pouvant également être utiles à des fins prophylactiques et thérapeutiques.

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