Method and apparatus for designing molecules with desired...

G - Physics – 06 – F

Patent

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G06F 17/50 (2006.01) B01J 19/00 (2006.01) C07K 1/00 (2006.01) C07K 1/04 (2006.01)

Patent

CA 2166397

A method of and apparatus are disclosed for evolving successive populations of molecular structures and evaluating each evolved structure of each population with desired physical and/or theoretical properties. An initial population of molecules is provided (12, 14) in terms of representations of a number of member molecules. Evaluation is performed by a fitness function (16, 18), which compares the initial population and evolved generations of member representations with the set of desired properties to provide a numerical measure or value of fitness for each structure (20, 22). That numerical value indicates how closely the compared member representation corresponds with the set of desired properties (24, 26). The next population is generated by changing the structure of selected molecules of a population dependent upon the numerical measure of fitness (28), and the process repeats (30, 14). Subsequent populations evolve towards even better fitness. The process is terminated when an acceptable molecule evolves.

Un procédé et un appareil permettent de développer des populations successives de structures moléculaires et d'évaluer chaque structure développée de chaque population ayant les propriétés physiques et/ou théoriques voulues. On part d'une population initiale de molécules (12, 14) en termes de représentations d'une pluralité de molécules membres. L'évaluation est effectuée au moyen d'une fonction d'aptitude (16, 18) qui compare la population initiale et des générations développées de représentations des molécules membres avec l'ensemble de propriétés voulues, afin de donner une mesure ou une valeur numérique de l'aptitude de chaque structure (20, 22). Cette valeur numérique indique dans quelle mesure la représentation de molécules membres ayant fait l'objet de la comparaison correspond à l'ensemble de propriétés voulues (24, 26). On génère la population suivante en changeant la structure de molécules sélectionnées d'une population en fonction de la mesure numérique d'aptitude (28), et on répète le processus (30, 14). Les populations ultérieures se développent en devenant de plus en plus aptes. On met fin au processus lorsqu'une molécule acceptable est développée.

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