2031 oxidoreductase

Details 2031 oxidoreductase 2031 oxidoreductase

C - Chemistry, Metallurgy

12

Q

C12Q 1/26 (2006.01)

Patent

CA 2558680

Method of identifying an anti-fungal agent which targets an essential protein or gene of a fungus comprising contacting a candidate substance with (i) a NADH:flavin oxidoreductase protein which comprises the sequence shown by SEQ ID N0:3, (ii) a NADH:flavin oxidoreductase protein which is a homologue of (i) and which comprises the sequence shown by SEQ ID NO: 8, 12, 14, 19, 24, 42, 44, 83 or 85, (iii) a protein which has 50 % identity with (i) or (ii), (iv) a protein comprising a fragment of (i), (ii) or (iii) which fragment has a length of at least 50 amino acids, (v) a polynucleotide that comprises sequence which encodes (i), (ii), (iii) or (iv), (vi) a polynucleotide comprising sequence which has at least 70 % identity with the coding sequence of (v), and determining whether the candidate substance binds or modulates (i), (ii), (iii), (iv), (v) or (vi), wherein binding or modulation of (i), (ii), (iii), (iv), (v) or (vi) indicates that the candidate substance is an anti-fungal agent.

L'invention concerne un procédé pour identifier un agent antifongique qui a pour cible une protéine ou un gène essentiel(le) d'un champignon. Ce procédé comprend les étapes qui consistent : à mettre en contact une substance d'intérêt potentiel avec : (i) une protéine d'oxydoréductase NADH:flavine qui comprend la séquence identifiée par SEQ ID N0:3 ; (ii) une protéine d'oxydoréductase NADH:flavine qui est un homologue de (i) et qui comprend la séquence identifiée par SEQ ID NO: 8, 12, 14, 19, 24, 42, 44, 83 ou 85 ; (iii) une protéine qui présente 50 % d'identité avec (i) ou (ii) ; (iv) une protéine comprenant un fragment de (i), (ii) ou (iii) qui comporte au moins 50 acides aminés ; (v) un polynucléotide comportant une séquence qui encode (i), (ii), (iii) ou (iv) ; (vi) un polynucléotide qui comprend une séquence présentant au moins 70 % d'identité avec la séquence codante de (v), et ; à déterminer si la substance d'intérêt potentiel se fixe sur ou module (i), (ii), (iii), (iv), (v) ou (vi), la fixation ou la modulation de (i), (ii), (iii), (iv), (v) ou (vi) indiquant si la substance d'intérêt potentiel est un agent antifongique.

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