A method for ab initio determination of macromolecular...

G - Physics – 01 – N

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G01N 33/48 (2006.01) G01N 23/20 (2006.01) G06F 1/00 (2006.01) G06F 17/14 (2006.01)

Patent

CA 2416517

A computational method for the discovery and design of therapeutic compounds is provided. The methods used rely on an accurate inter-conversion of three- dimensional molecular spatial information between two alternative orthogonal representations. These methods enhance the accuracy for determining ab initio phases of macromolecular crystallographic structures at any desired experimental resolution limit. The computational technique employed utilizes a software program and associated algorithms. This method is an improvement over the current methods of drug discovery which often employs a random search through a large library of synthesized chemical compounds or protein molecules for bio-activity related to a specific therapeutic use. The development of computational methods for the prediction of specific molecular activity suggests a method for describing the contents of non-centro-symmetric sparsely packed crystals and the information provided therefrom will facilitate the design of novel chemotherapeutics or other chemically useful compounds.

La présente invention concerne un procédé informatique permettant de rechercher et de concevoir des composés thérapeutiques. Les procédés utilisés reposent sur une interconversion précise des informations spatiales moléculaires tridimensionnelles entre deux représentations orthogonales équivalentes. Ces procédés améliorent la précision pour déterminer les phases ab initio de structures cristallographiques macromoléculaires à n'importe quelle limite de résolution expérimentale désirée. La technique informatique employée utilise un programme logiciel et des algorithmes associés. Ce procédé est un procédé amélioré par rapport aux procédés actuels de recherche de médicaments qui utilisent souvent une recherche aléatoire dans une grande banque de composés chimiques de synthèse ou de molécules de protéines pour une bio-activité se rapportant à une utilisation thérapeutique spécifique. La mise au point des procédés informatiques permettant de prédire une activité moléculaire spécifique propose un procédé de description du contenu de cristaux faiblement condensés non centro-symétriques et les informations fournies par ce dernier facilitent la mise au point de nouvelles substances chimiothérapeutiques ou d'autres composés utiles du point de vue chimique.

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