A method for counting and segmenting viral particles in an...

C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q

Patent

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Details

C12Q 1/70 (2006.01) C12M 1/34 (2006.01) G06M 11/04 (2006.01) G06T 7/60 (2006.01)

Patent

CA 2688153

The method is for intracellular counting and segmentation of viral particles in an image. An image is provided that has a plurality of items therein. A radius range of viral particles is determined. Round items in the image having a radius within the predetermined radius range are identified. Elliptical items that are formable from the predetermined radius range are determined. The round and elliptical items identified into groups are sorted. The viral particles among the round and elliptical items are identified. For example, the method may be used for intracellular counting and segmentation of siRNA treated human cytomegaloviral particles in TEM images.

La présente invention concerne un procédé pour un comptage et une segmentation intracellulaire de particules virales dans une image. Une image est fournie, comprenant une pluralité d'objets. Une plage de rayons de particules virales est déterminée. Des objets ronds dans l'image ayant un rayon compris dans la plage de rayons prédéterminée sont identifiés. Des objets elliptiques qui peuvent être formés à partir de la plage de rayons prédéterminée sont déterminés. Les objets ronds et elliptiques identifiés sont triés en groupes. Les particules virales parmi les objets ronds et elliptiques sont identifiées. Par exemple, le procédé peut être utilisé pour un comptage et une segmentation intracellulaire de particules cyto-mégalovirales humaines traitées selon siRNA dans des images TEM.

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