C - Chemistry – Metallurgy – 40 – B
Patent
C - Chemistry, Metallurgy
40
B
C40B 30/04 (2006.01) G01N 33/68 (2006.01) C07K 1/04 (2006.01)
Patent
CA 2350141
The invention relates to a method for determining a mimotope sequence for a receptor comprising the steps of: a) providing a library of test sequences; b) determining the activity of each test sequence of the library towards the receptor; c) identifying a test sequence comprising at a certain position a building block which, according to the results of step b) is favored at said position; d) providing a next library of test sequences, based on said test sequence identified in step c), by replacing a building block at selected positions of the identified test sequence with selected building blocks; e) determining the activity of each test sequence of the library provided in step d) towards the receptor; f) identifying a test sequence comprising at a certain position a building block which, according to the results of step e), is favored at said position; g) repeating steps d) - f) for the library of test sequences provided in step d), for a number of cycles sufficient for finding in step f) a mimotope sequence that gives sufficient activity towards the receptor.
L'invention concerne une méthode de détermination d'une séquence de mimotope destinée à un récepteur. Cette méthode consiste à: a) fournir une banque de séquences d'essai; b) déterminer l'activité de chaque séquence d'essai de la banque envers le récepteur; c) identifier une séquence d'essai comprenant en une certaine position un motif structural qui, en fonction des résultats de l'étape b), est favorisé en ladite position; d) fournir une autre banque de séquences d'essai, à partir de ladite séquence d'essai identifiée à l'étape c), en remplaçant un motif structural aux positions sélectionnées de la séquence d'essai identifiée, par les motifs structuraux sélectionnés; e) déterminer l'activité de chaque séquence d'essai de la banque fournie à l'étape d) envers le récepteur; f) identifier une séquence d'essai comprenant en une certaine position un motif structural qui, en fonction des résultats de l'étape e), est favorisé en ladite position; g) répéter les étapes d) à f) pour la banque de séquences d'essai fournie à l'étape d), pour un nombre de cycles suffisant pour permettre de trouver à l'étape f) une séquence de mimotope qui présente une activité suffisante envers le récepteur.
Puijk Wouter Cornelis
Slootstra Jelle Wouter
Fetherstonhaugh & Co.
Pepscan Systems B.v.
LandOfFree
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Profile ID: LFCA-PAI-O-1811833