C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q
Patent
C - Chemistry, Metallurgy
12
Q
C12Q 1/68 (2006.01)
Patent
CA 2325854
A method for characterising nucleic acid molecules comprises the steps of: i) introducing a modified base which is a substrate for a DNA glycosylase into a DNA molecule; ii) excising the modified base by means of said DNA glycosylase so as to generate an abasic site; iii) cleaving the DNA at the abasic site so as to generate an upstream DNA fragment that can be extended; and iv) incubating the extendible upstream fragment in the presence of an enzyme, for example a polymerase or a ligase allowing for extension thereof and a template nucleic acid and analysing the resultant fragment(s). The invention provides a novel, versatile and simple method using the above-mentioned extendible upstream DNA fragments which allows characterisation of nucleic acids and which has advantages over existing methods. One of the most important uses (but not the only use) of the method according to the invention is to scan or check a fragment of DNA (target nucleic acid) for the presence or absence of a mutation.
L'invention concerne une méthode de caractérisation de molécules d'acide nucléique, qui consiste à: i) introduire une base modifiée constituant un substrat pour une glycosylase d'ADN dans une molécule d'ADN; ii) exciser la base modifiée au moyen de ladite glycosylase d'ADN, de manière qu'un site abasique soit généré; iii) cliver l'ADN au niveau du site abasique, de manière qu'un fragment d'ADN d'amont puisse être étendu; et iv) laisser incuber le fragment d'amont extensible, en présence d'une enzyme, par exemple d'une polymérase ou d'une ligase, de sorte qu'il s'étende, et un acide nucléique matriciel et analyser le(s) fragment(s) résultants. L'invention porte aussi sur une méthode nouvelle, simple et polyvalente dans laquelle les fragments d'ADN d'amont extensibles susmentionnés sont utilisés, permettant la caractérisation d'acides nucléiques et présentant plusieurs avantages par rapport aux méthodes existantes. Une des utilisations la plus importante (mais pas la seule) de la méthode de l'invention, est le balayage ou le contrôle d'un fragment d'ADN (acide nucléique cible), à la recherche de la présence ou l'absence d'une mutation.
Mccarthy Thomas Valentine
Vaughan Patrick Martin
Enterprise Ireland Trading As Bioresearch Ireland
Osler Hoskin & Harcourt Llp
University College Cork - National University Of Ireland Cork
LandOfFree
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Profile ID: LFCA-PAI-O-1593919