A systematic approach to mechanism-of-response analyses

C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q

Patent

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C12Q 1/68 (2006.01) G01N 33/00 (2006.01) G01N 33/50 (2006.01) G01N 33/566 (2006.01)

Patent

CA 2416708

The present invention provides methods for identifying new compositions having one or more desired activities, and methods for identifying organisms that are sensitive or resistant to a drug composition. The methods are based upon genetic response profiles generated for an initial set of compositions, where at least one member of the set of compositions has been shown to have at least a first demonstrated activity and a second desired activity. By examining the patterns of genetic and cellular responses (i.e., the genetic response profiles) evoked by a first set of "known" compositions having varying degrees of one or both activities, a preferred pattern of genetic responses can be formulated which corresponds to the desired activity, but not to the demonstrated activity. Additional sets of compounds or compositions can then be screened for the desired genetic response profile, thereby identifying new compositions having the desired activity. Furthermore, populations of organisms can be screened for sensitivity or resistance to drug compositions, based upon comparison of genetic response profiles to the preferred pattern.

La présente invention porte sur des procédés d'identification de nouvelles compositions ayant une ou plusieurs activités désirées, et sur des procédés d'identification d'organismes qui sont sensibles ou résistants à une composition de médicaments. Les procédés sont basés sur des profils de réponses génétiques générés pour un ensemble initial de compositions, au moins un élément de l'ensemble de compositions s'avérant avoir au moins une première activité manifeste et une seconde activité désirée. En examinant les phénotypes des réponses génétiques et cellulaires ( tels que les profils de réponses génétiques) évoqués par un premier ensemble de compositions <= connues >= présentant divers degrés de l'une ou deces deux activités, un phénotype préféré de réponses génétiques peut être formulé qui correspond à l'activité désirée, et non à l'activité manifeste. Des ensembles additionnels de composés ou compositions peuvent être ensuite criblés pour le profil désiré de réponse génétique, ce qui permet d'identifier de nouvelles compositions ayant l'activité désirée. En outre, des populations d'organismes peuvent être criblées pour leur sensibilité ou leur résistance aux compositions de médicaments, à partir de la comparaison des profils de réponses génétiques avec le phénotype préféré.

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