G - Physics – 01 – N
Patent
G - Physics
01
N
G01N 30/86 (2006.01)
Patent
CA 2636025
A two-step alignment method for temporally aligning LC-MS data files representative of three-dimensional chromatographic surfaces is disclosed. The method includes apre- alignment step whereby the data files are roughly aligned using a transformation-based correlation analysis of base peak information. The pre-aligned files are used as input to a full alignment step, in which a correlation matrix is computed from the full MS scan information, and an optimal path is traced through the resultant correlation matrix to identify corresponding scan numbers. The use of the pre-alignment step substantially reduces the computational expense of the full alignment step and improves the accuracy and reliability of the alignment.
L'invention concerne un procédé d'alignement en deux étapes permettant d'aligner temporairement des fichiers de données LC-MS représentant des surfaces chromatographiques tridimensionnelles. Le procédé comprend une étape de pré-alignement au cours de laquelle les fichiers de données sont plus ou moins alignés à l'aide d'une analyse de corrélation basée sur la transformation des informations de crête de base. Les fichiers pré-alignés sont utilisés comme entrées dans une étape d'alignement intégral, dans laquelle une matrice de corrélation est calculée à partir des informations de balayage MS complet, et une trajectoire optimale est tracée à travers la matrice de corrélation obtenue pour identifier des nombres de balayage correspondants. L'utilisation de l'étape de pré-alignement permet de réduire sensiblement le coût informatique de l'étape d'alignement intégral et d'améliorer la précision et la fiabilité de l'alignement.
Freedman Gordon
Thermo Finnigan Llc
LandOfFree
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