Acyl glucosaminyl inositol amidase family and methods of use

C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q

Patent

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Details

C12Q 1/00 (2006.01) C07H 21/04 (2006.01) C07K 16/00 (2006.01) C12N 5/00 (2006.01) C12N 9/80 (2006.01) C12N 15/00 (2006.01) C12P 19/00 (2006.01) C12P 19/26 (2006.01)

Patent

CA 2393584

The present invention provides a family of bacterial acyl glucosaminylinositol amidases with amidase activity against S-conjugate amides, particularly mycothiol-derived S-conjugate amides. The invention amidases are characterized by a highly conserved 20 amino acid N-terminal region and four highly conserved histidine-containing regions and by having amidase activity, particularly amide hydrolase activity. The invention further provides methods for using the invention amidases in drug screening assays to determine compounds with antibiotic activity or compounds that inhibit activity or production of endogenous acyl glucosaminyl inositol amidase in bacteria. The invention further provides methods for detoxifying a toxic substance by contacting the toxic substance with an invention amidase, for example, by expression of the amidase under environmental conditions in a bacterium.

La présente invention concerne une famille d'acyle glucosaminyle inositol amidases bactériennes présentant une activité contre les amides à conjugué S, et notamment les amides à conjugué S issus du mycothiol. Les amidases de l'invention sont caractérisées par une région N-terminale de 20 acides aminés à conservation de séquence élevée et par quatre régions contenant de l'histidine à conservation de séquence élevée. De plus, ces amidases se caractérisent en ce qu'elles produisent une activité d'amidase, et notamment une activité d'amide hydrolase. L'invention se rapporte en outre à des méthodes permettant d'utiliser les amidases de cette invention dans des analyses de criblage de médicaments pour déterminer la présence de composés dotés d'une activité antibiotique ou de composés inhibant l'activité ou la production d'acyle glucosaminyle inositol amidase endogène dans une bactérie. L'invention concerne finalement des méthodes permettant de détoxiquer une substance toxique en la mettant en contact avec une amidase de l'invention, notamment par expression de cette amidase dans une bactérie sous certaines conditions environnementales.

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