Affinity labeling libraries and applications thereof

Details Affinity labeling libraries and applications thereof Affinity labeling libraries and applications thereof

C - Chemistry, Metallurgy

07

K

C07K 1/13 (2006.01) C07K 1/00 (2006.01) C07K 1/04 (2006.01) C40B 30/04 (2006.01) G01N 33/53 (2006.01) G01N 33/58 (2006.01)

Patent

CA 2245558

Novel methods and compositions are provided for preferentially bonding an oligomeric molecule to a macromolecular target where the target is a member of a complex mixture and/or there is preferential bonding at one of a plurality of available bonding sites of the macro--molecular target. The methods represent a complete system for both producing and identifying affinity label molecules from a combinatorial library which preferentially bind to a macromolecular target or target site and preferentially binding those affinity labels to a macromolecule of interest either ex vivo or in vivo. Macromolecular targets include a variety of cellular- and non-cellular-associated proteins. Affinity la-bel molecules and combinatorial libraries thereof find use in providing means for inhibiting catalytic enzyme activity, accomplishing agonism and/or antagonism at biological receptor sites, attaching biologically active compounds to specific target sites in vivo, labeling macromolecules for premature destruction in vivo, directing biologically active com-pounds to specific sites in vivo and exploiting numerous sites that have been hitherto difficult to target, including tumorigenic-specific sites.

L'invention concerne de nouvelles méthodes et compositions pour fixer de manière préférentielle une molécule oligomère sur une cible macromoléculaire, lorsque cette cible est un élément d'un mélange complexe et/ou qu'il est préférable que la fixation se fasse au niveau d'un site parmi plusieurs sites disponibles de fixation de la cible macromoléculaire. Les méthodes représentent un système complet à la fois de production et d'identification de molécules de marquage d'affinité à partir d'une bibliothèque combinatoire, lesquelles se fixent de préférence sur une cible macromoléculaire ou sur un site cible, et de préférence sur une macromolécule d'intérêt soit ex vivo soit in vivo. Les cibles macromoléculaires comprennent une variété de protéines d'association cellulaire et non-cellulaire. Les molécules de marquage d'affinité et leurs bibliothèques combinatoires trouvent application pour inhiber l'activité d'enzyme catalytique, accomplir l'agonisme et/ou l'antagonisme au niveau de sites récepteurs biologiques, fixer des composés biologiquement actifs sur des sites cibles spécifiques in vivo, marquer des macromolécules pour destruction prématurée in vivo, diriger des composés biologiquement actifs vers des sites spécifiques in vivo et exploiter de nombreux sites qui ont été jusqu'à présent difficiles à cibler, y compris le site spécifique aux tumeurs.

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