G - Physics – 06 – F
Patent
G - Physics
06
F
G06F 19/18 (2011.01) C12Q 1/68 (2006.01) C40B 30/02 (2006.01)
Patent
CA 2710426
A method of determining an allelic type of a specific individual, comprising: accessing a database of genetic information on a plurality of individuals, the genetic information comprising: the allelic type of each individual; and the type of each of a plurality of genetic markers for each individual; categorizing the data in the database into a plurality of groups of individuals, such that all individuals having the same allelic type are in the same group, and each group represents a different allelic type; inputting data comprising the type of each of a plurality of genetic markers of the specific individual having an unknown allelic type; specifying a set of genetic markers for which type information is known both for the individuals in the database and for the specific individual; applying a population genetic model to calculate the likelihood of sampling, from some or all of the groups in turn, the input type data of the specified set of genetic markers for the specific individual; and determining the allelic type of the specific individual based on the calculated likelihoods.
L'invention porte sur un procédé de détermination d'un type allélique d'un individu spécifique. Le procédé consiste à évaluer une base de données d'informations génétiques portant sur une pluralité d'individus et comprenant le type allélique de chaque individu et le type de chacun des marqueurs d'une pluralité de marqueurs génétiques pour chaque individu; à catégoriser les données de la base de données en une pluralité de groupes d'individus, de telle sorte que tous les individus présentant le même type allélique soient dans le même groupe, et que chaque groupe représente un type allélique différent; à mettre en entrée des données comprenant le type de chacun des marqueurs d'une pluralité de marqueurs génétiques de l'individu spécifique présentant un type allélique inconnu; à spécifier un ensemble de marqueurs génétiques pour lequel des informations de type sont connues à la fois pour les individus de la base de données et pour l'individu spécifique; à appliquer un modèle génétique de population pour calculer la probabilité d'échantillonnage, selon tout ou partie des groupes considérés tour à tour, des données de type mises en entrée de l'ensemble spécifié de marqueurs génétiques pour l'individu spécifique; et à déterminer le type allélique de l'individu spécifique selon les probabilités calculées.
Donnelly Peter James
Leslie Stephen James
Mcvean Gilean
Isis Innovation Limited
Norton Rose Or S.e.n.c.r.l. S.r.l./llp
LandOfFree
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Profile ID: LFCA-PAI-O-2076435