C - Chemistry – Metallurgy – 12 – N
Patent
C - Chemistry, Metallurgy
12
N
C12N 15/11 (2006.01) C07K 1/04 (2006.01) C07K 2/00 (2006.01) C07K 4/00 (2006.01) C12N 15/10 (2006.01) C12N 15/62 (2006.01) C12N 15/70 (2006.01) C12Q 1/68 (2006.01) C12Q 1/70 (2006.01) G01N 33/53 (2006.01) G01N 33/554 (2006.01)
Patent
CA 2223183
An anchor library is described. A collection of recombinant vectors having a nucleic acid encoding a displayed peptide sequence is provided. The displayed peptide sequence of each of the vectors comprises X1(Y1)c1X2(Y2)c2X3(Y3)c3X4, wherein each X1, X2, X3 and X4 is an amino acid residue and any of X1, X2, X3 and X4 can be the same or different from any one other, wherein each Y1, Y2 and Y3 is alanine or glycine or a combination of alanine and glycine that is respectively c1, c2 and c3 amino acid residues long and any of Y1, Y2 and Y3 if present can be the same or different from any one other, wherein each of c1, c2 and c3 is 0 to about 20, wherein X1 and X4 are each attached to an amino acid residue that flanks the displayed peptide sequence. Preferably, at least about 105 to about 108 permutations of all possible permutations of the displayed peptide sequence are present in the anchor library. Preferably, the library does not contain more than about 10 % of displayed peptide sequences different from the first mentioned displayed peptide sequences. Also described are methods of making anchor libraries and methods of using anchor libraries to identify a peptide sequence that binds to a target. Recombinant vectors, filamentous phage, nucleic acid molecules and proteins are also provided.
Cette invention concerne une banque d'ancres et plus particulièrement un ensemble de vecteurs recombinés possédant un acide nucléique codant une séquence peptidique affichée. La séquence peptidique affichée de chacun des vecteurs comprend X?1¿(Y?1¿)c?1¿X?2¿(Y?2¿)c?2¿X?3¿(Y?3¿)c?3¿X?4¿, où chaque X?1¿, X?2¿, X?3¿ et X?4¿ est un reste d'acide aminé et où les X?1¿, X?2¿, X?3¿ et X?4¿ peuvent être identiques ou différents, où chaque Y?1¿, Y?2¿ et Y?3¿ est de l'alanine ou de la glycine ou une combinaison d'alanine et de glycine d'une longueur respective de c?1¿, c?2¿ et c?3¿ d'acides aminés, et où les Y?1¿, Y?2¿ et Y?3¿, s'ils sont présents, peuvent être identiques ou différents, où chaque c?1¿, c?2¿ et c?3¿ est compris entre 0 et environ 20, où chaque X?1¿ et X?4¿ est attaché à un reste d'acide aminé bordant la séquence peptidique affichée. Préférablement, un minimum d'environ 10?5¿ à environ 10?8¿ permutations de toutes les permutations possibles de la séquence peptidique affichée sont présentes dans la banque d'ancres. Préférablement, ladite banque ne contient pas plus d'environ 10 % environ de séquences peptidiques affichées différentes des premières séquences peptidiques affichées mentionnées. Cette invention concerne également les procédés permettant de constituer des banques d'ancres, ainsi que les procédés permettant de les utiliser pour identifier une séquence peptidique se liant à une cible. Elle concerne enfin des vecteurs recombinés, un phage filamenteux, des molécules d'acides nucléiques et des protéines.
Benjamin Howard
Gefter Malcolm
Signer Ethan
Ogilvy Renault Llp/s.e.n.c.r.l.,s.r.l.
Pharmaceutical Peptides Inc.
LandOfFree
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Profile ID: LFCA-PAI-O-2033831