G - Physics
06
F
G06F 17/30 (2006.01) G06F 19/00 (2006.01) G06G 7/48 (2006.01) G06G 7/58 (2006.01) G01N 33/68 (2006.01)
Patent
CA 2469762
The invention relates to a method for annotating protein sequences consistently, using disparate secondary database protein family information. In the method, information relating to the family to which a protein belongs is derived from two or more secondary databases (2DBs), each 2DB being generated by a different modelling approach and wherein at least one 2DB provides no single alignment of protein sequences in each family. The method involves the steps of extracting protein family information from said at least two 2DBs; and incorporating this information into a single modelling infrastructure.
L'invention concerne un procédé destiné à annoter de façon uniforme des séquences de protéines au moyen de diverses informations de familles de protéines de base de données secondaire. Selon l'invention, les informations concernant la famille à laquelle appartient une protéine sont dérivées d'au moins deux bases de données secondaires (2DB). Chacune de ces bases de données est générée par une approche de modélisation différente, et au moins une de ces bases de données ne présente pas d'alignement individuel de séquences de protéines dans chaque famille. Le procédé selon l'invention consiste à extraire des informations de familles de protéines desdites bases de données, et à intégrer ces informations dans une infrastructure de modélisation individuelle.
Couch Matthew
Cuff James
Swindells Mark Basil
Inpharmatica Limited
Kirby Eades Gale Baker
LandOfFree
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Profile ID: LFCA-PAI-O-2021001