G - Physics – 06 – F
Patent
G - Physics
06
F
G06F 19/00 (2006.01) C07K 1/00 (2006.01) G06F 17/50 (2006.01)
Patent
CA 2083877
A constraint condition generating apparatus generates a constraint condition which should be output to a molecular dynamics simulator for simulating a behavior of a molecule based on a molecular dynamics method under the constraint condition for freezing a part of the degree of freedom within the molecule. This apparatus comprises bond constraint condition setting and releasing unit for setting a bond constraint list comprising the number of two atoms whose bond are to be constrained and a bonding distance between two atoms, and for releasing the constraint of the bond of two atoms, angle constraint condition setting and releasing means for setting an angle constraint condition including a bonding distance between two atoms which are not common and for releasing a part of angle constraint condition in accordance with a designation by a user; and a torsion constraint condition setting and releasing unit for setting a torsion constraint condition including a bonding distance between two atoms which are not common, and for releasing a part of a constraint condition in accordance with a designation by a user.
Un appareil générateur de conditions de contraintes produit une condition de contrainte, destinée à un simulateur de dynamique moléculaire afin de simuler le comportement d'une molécule, basé sur une méthode de dynamique moléculaire dans la condition de contrainte, pour le gel d'une partie du degré de liberté à l'intérieur de la molécule. Cet appareil comporte une unité d'application et de suppression de condition de contrainte de liaison, pour l'obtention d'une liste de contrainte de liaison, comprenant le numéro de deux atomes dont la liaison doit faire l'objet de la contrainte et la distance de liaison entre les deux atomes, et pour la suppression de la contrainte de liaison des deux atomes; il comporte aussi des moyens d'application et de suppression de la condition de contrainte d'angle pour appliquer une condition de contrainte d'angle, incluant la distance de la liaison entre deux atomes qui ne sont pas communs, et pour supprimer une partie de la condition de contrainte d'angle conformément à la spécification d'un utilisateur; enfin, il comporte une unité d'application et de suppression de condition de contrainte de torsion, pour appliquer une condition de contrainte de torsion, incluant la distance de la liaison entre deux atomes qui ne sont pas communs, et pour supprimer une partie de la condition de contrainte conformément à la spécification d'un utilisateur.
Fukuda Ikuo
Mikami Masuhiro
Namiki Takefumi
Sakai Kota
Takeuchi Munetaka
Fetherstonhaugh & Co.
Fujitsu Limited
LandOfFree
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Profile ID: LFCA-PAI-O-1701637