Artificial proteins with reduced immunogenicity

C - Chemistry – Metallurgy – 07 – K

Patent

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Details

C07K 19/00 (2006.01) A61K 39/395 (2006.01) C07K 1/107 (2006.01) C07K 14/52 (2006.01) C07K 16/18 (2006.01) C07K 16/28 (2006.01) C07K 16/30 (2006.01) C12N 15/00 (2006.01) C12N 15/62 (2006.01)

Patent

CA 2438628

The invention relates to artificial modified proteins, preferably fusion proteins, having a reduced immunogenicity compared to the parent non-modified molecule when exposed to a species in vivo. The invention relates, above all, to novel immunoglobulin fusion proteins which essentially consist of an immunoglobulin molecule or a fragment thereof covalently fused via its C- terminus to the N-terminus of a biologically active non-immunoglobulin molecule, preferably a polypeptide or protein or a biologically active fragment thereof. In a specific embodiment, the invention relates to fusion proteins consisting of an Fc portion of an antibody which is fused as mentioned to the non-immunological target molecule which elicits biological or pharmacological efficacy. The molecules of the invention have amino acid sequences which are altered in one or more amino acid residue positions but have in principal the same biological activity as compared with the non- altered molecules. The changes are made in regions of the molecules which are identified as T-cell epitopes, which contribute to an immune reaction in a living host. Thus, the invention also relates to a novel method of making such fusion proteins by identifying said epitopes comprising calculation of T-cell epitope values for MHC Class II molecule binding sites in a peptide by computer-aided methods.

L'invention concerne des protéines modifiées artificielles, de préférence des protéines hybrides, possédant une immunogénicité réduite comparée à celle d'une molécule parente inchangée, lorsqu'elle se trouve exposée à une espèce in vivo. L'invention concerne en particulier de nouvelles protéines hybrides d'immunoglobuline qui se composent principalement d'une molécule d'immunoglobuline ou d'un fragment de celle-ci hybridée de manière covalente par son terminus-C au terminus-N d'une molécule non-immunoglobuline biologiquement active, de préférence un polypeptide ou une protéine ou encore un fragment biologiquement actif de ceux-ci. Selon un des modes de réalisation de la présente invention, les protéines hybrides sont composées d'une partie Fc d'un anticorps hybridé comme mentionné à la molécule cible non-immunologique qui choisit une efficacité pharmacologique ou biologique. Les molécules décrites par la présente invention présentent des séquences aminoacides modifiées en une ou plusieurs portions de résidu aminoacide mais possèdent principalement la même activité biologique que celle des molécules non modifiées. On réalise les modifications sur des régions de molécules identifiées comme des épitopes de lymphocytes T, qui contribuent à une réaction immune chez un hôte vivant. En conséquence, l'invention concerne également un nouveau procédé de fabrication de ces protéines hybrides par l'identification desdites épitopes consistant à calculer les valeurs des épitopes de lymphocytes T pour les sites de liaison de catégorie II MHC dans un peptide au moyen de procédés assistés par ordinateur.

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