Assay

Details Assay Assay

C - Chemistry, Metallurgy

12

Q

C12Q 1/68 (2006.01)

Patent

CA 2385920

A diagnostic method for the detection of the 5T, 7T and 9T alleles in intron (8) of the human CFTR gene which method comprises contacting a test sample of nucleic acid from an individual with a multiplex of diagnostic primers comprising (i) 5T variant primer 5'(N)nAAAGAC3', (ii) 7T variant primer 5'(N*)n*(N)nAAAAGC3' and (iii) 9T variant primer 5'(N*)n*(N)nAAAATC3', wherein N represents additional nucleotides which base pair with the corresponding genomic sequence in the respective allele and n is an integer between 10 and 30 and N* represents additional non-homologous nucleotides which do not base pair with the corresponding genomic sequence in the respective allele and n* is an integer between 5 and 60, in the presence of appropriate nucleotide triphosphates and an agent for polymerisation, such that a diagnostic primer is extended only when the corresponding allelic variant is present in the sample; and detecting the presence or absence of the allelic variant by reference to the presence or absence of a diagnostic primer extension product.

L'invention porte sur une méthode de diagnostic par détection des allèles 5T, 7T et 9T de l'intron (8) du gène humain CFTR consistant à mettre en contact un prélèvement d'acide nucléique d'un individu avec un jeu d'amorces comportant les variantes (i) 5T / 5'(N)nAAAGAC3', (ii) 7T / 5'(N*)n*(N)nAAAAGC3' et (iii) 9T / 5'(N*)n*(N)nAAAATC3', dans lesquelles: N représente des nucléotides additionnels formant des paires de base avec les séquences génomiques correspondantes de leurs allèles respectives, n est un entier entre 10 et 30, et N* représente des nucléotides additionnels non-homologues ne formant pas de paires de base avec les séquences génomiques correspondantes de leurs allèles respectives, et n* un entier entre 5 et 60, cela en présence de triphosphates nucléotidiques appropriés et d'un agent de polymérisation; ainsi, l'amorce de diagnostique ne s'étend que si la variante correspondante d'allèle est présente dans le prélèvement; puis à détecter la présence ou l'absence de la variante d'allèle par référence à la présence ou à l'absence du produit d'extension de l'amorce de diagnostic.

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Profile ID: LFCA-PAI-O-1502176