C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q
Patent
C - Chemistry, Metallurgy
12
Q
C12Q 1/68 (2006.01)
Patent
CA 2503704
The invention provides an assay method for detecting fungal infection of soil or vegetables by pathogenic fungal species, in particular M. acerina, F. carotae and Pythium species, said method comprising: obtaining a sample of soil or vegetable; treating said sample to lyse fungal cells therein; using an oligonucleotide primer pair, effecting a polymerase chain reaction on DNA released by lysis of the fungal cells; and detecting DNA fragments generated by said polymerase chain reaction; wherein said primer pair comprises an 18- to 24-mer having the ability to hybridize to one of the oligonucleotide sequences of formulae (Ia), (Ib), (IIa), (IIb), (IIIa), (IIIb), (IVa), (IVb), (Va), (Vb), (VIa), (VIb), (VIIa), (VIIb), (VIIIa), (VIIIb), (IXa), (IXb), (Xa), (Xb), (XIa), (XIb), (XIIa), (XIIb), (XIIIa), (XIIIb), (XIVa) and (XIVb).
Cette invention concerne une méthode de criblage permettant de détecter une infection fongique de la terre ou de végétaux par des espèces fongiques pathogènes, en particulier les espèces M. acerina, F. carotae et Pythium. Cette méthode consiste : à prélever un échantillon de terre ou de végétal ; à traiter cet échantillon afin de lyser les cellules fongiques qu'il contient ; à utiliser une paire d'amorces oligonucléotidiques ; à effectuer une réaction en chaîne de la polymérase sur l'ADN libérée par la lyse des cellules fongiques ; puis à détecter des fragments d'ADN générés par cette réaction en chaîne de la polymérase. La paire d'amorces comprend entre 18 et 24 mères qui ont la capacité de s'hybrider avec une des séquences oligonucléotidiques représentées par les formules (Ia), (Ib), (IIa), (IIb), (IIIa), (IIIb), (IVa), (IVb), (Va), (Vb), (VIa), (VIb), (VIIa), (VIIb), (VIIIa), (VIIIb), (IXa), (IXb), (Xa), (Xb), (XIa), (XIb), (XIIa), (XIIb), (XIIIa), (XIIIb), (XIVa) et (XIVb).
Hermansen Arne
Klemsdal Sonja
Lund Grete
Naerstad Ragnhild
Wanner Leslie
Carrotech As
Fetherstonhaugh & Co.
LandOfFree
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Profile ID: LFCA-PAI-O-1911136