Assessing data sets

C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q

Patent

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C12Q 1/68 (2006.01) C07H 21/00 (2006.01) C40B 30/00 (2006.01) G06F 17/18 (2006.01) C12N 15/11 (2006.01) C12N 15/31 (2006.01) G06F 19/00 (2006.01) G06Q 10/00 (2006.01)

Patent

CA 2479469

The present invention relates generally to a method for assessing data sets, such as multi-parametric data sets. More particularly, the present invention contemplates a method for determining differences between objects in a data set wherein each object is described using one or more parameters. The present invention is particularly useful inter alia in the field of bioinformatics such as to determine differences in populations of nucleotide or amino acid sequences [100]. Such differences are referred to herein as polymorphisms such as polymorphisms within a sequence database. Populations so identified [110] may provide a fingerprint of inter alia a particular nucleic acid molecule, protein, trait or disease condition. The present invention extends, however, to identifying sub-populations of data relevant inter alia to commerce, industry or the environment. Once polymorphisms are identified, oligonucleotide or peptide based procedures may then be adopted to screen for particular informative polymorphisms in various clinical, environmental, industrial, domestic or laboratory environments.

L'invention concerne, de façon générale, un procédé d'évaluation d'ensembles de données, tels que des ensembles de données multiparamétriques. Plus particulièrement, l'invention concerne un procédé permettant de déterminer des différences entre des objets dans un ensemble de données, chaque objet étant décrit au moyen d'un ou de plusieurs paramètres. L'invention est particulièrement utilisée, notamment en bio-informatique, par exemple, pour déterminer des différences dans des populations de séquences de nucléotides ou d'aminoacides (100). De telles différences sont présentement référées par polymorphismes, tels que des polymorphismes dans une base de données de séquences. Des populations ainsi identifiées (110) peuvent fournir une fiche signalétique, notamment de molécules d'acide nucléiques particulières, de protéines, d'états de caractères ou de maladies. L'invention englobe également l'identification de sous-populations de données ayant trait, notamment, au commerce, à l'industrie ou à l'environnement. Une fois que les polymorphismes sont identifiés, des procédures basées sur des oligonucléotides ou des peptides peuvent alors être adoptées pour dépister des polymorphismes informatifs particuliers dans divers milieux cliniques, environnementaux, industriels, ainsi que dans des environnements domestiques ou de laboratoire.

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Profile ID: LFCA-PAI-O-2042008

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