Automatic genotype determination

C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q

Patent

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Details

C12Q 1/68 (2006.01) G06F 19/00 (2006.01)

Patent

CA 2177720

A method and device are provided for determin- ing the genotype at selected loci within genetic ma- terial obtained from a biological sample. One or more data sets are formed and probability distributions estab- lished. These distributions associate hypothetical reac- tion values with corresponding probabilities for each genotype of interest at the same locus or at different loci. The genotype is then determined based on these measures. The foregoing methods have been employed for automatic genotype determination based on assays using genetic bit analysis. The methods of the invention have been embodied in a device suitable for determin- ing the genotype at selected loci within genetic matedal obtained from the subject.

Procédé et dispositif de détermination du genotype au niveau de loci sélectionnés dans une matière génétique obtenue à partir d'un échantillon biologique. Un ou plusieurs ensembles de données sont formés et des répartitions de probabilité établies. Ces répartitions associent des valeurs de réaction hypothétique avec des probabilités correspondantes pour chaque génotype étudié sur le même locus ou en différents loci. On détermine ensuite le génotype sur la base de ces mesures. On a utilisé les procédés précités dans la détermination automatique du génotype sur la base de dosages utilisant une analyse d'éléments génétiques. Les procédés de l'invention ont été appliqués dans un dispositif adapté à la détermination du génotype au niveau de loci selectionnés dans une matière génétique prélevée sur le sujet.

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Profile ID: LFCA-PAI-O-2058200

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