Base-protected nucleotide analogs with protected thiol groups

C - Chemistry – Metallurgy – 07 – H

Patent

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Details

C07H 19/06 (2006.01) C07H 19/04 (2006.01) C07H 19/10 (2006.01) C07H 19/16 (2006.01) C07H 21/00 (2006.01) C07H 23/00 (2006.01) C12P 19/34 (2006.01) C12Q 1/68 (2006.01)

Patent

CA 2261892

The present invention is directed to protected thiol analogs of pyrimidine bases for syntheses of DNA and RNA by chemical or enzymatic methods. The subject analogs include reagents suitable for DNA or RNA synthesis via phosphoramidite, H-phosphonate or phosphotriester chemistry as well as reagents suitable for use by RNA and DNA polymerase, including thermostable polymerases employed by PCR or other nucleic acid amplification techniques. The nucleotide analogs synthesized by methods of this invention can thus be incorporated into oligonucleotides or polynucleotides, deprotected and derivatized with a functional group. In some cases the protecting groups are themselves antigenic and may be left on the oligonucleotides or polynucleotides for detection with antibodies. A method of synthesizing oligonucleotides with a functional group using the subject nucleotide analogs is also provided.

Cette invention se rapporte à des analogues à thiol protégés de bases de pyrimidine pour la synthèse de l'ADN et de l'ARN par voies chimiques ou enzymatiques. Ces analogues contiennent des réactifs appropriés pour la synthèse chimique de l'ADN ou de l'ARN par phosphoramidite, H-phosphonate ou phosphotriester, ainsi que des réactifs pouvant être utilisés par l'ARN-polymérase et l'ADN-polymérase, y compris par des polymérases thermostables utilisées pour la technique de réaction en chaîne de polymérase (PCR) et pour d'autres techniques d'amplification de l'acide nucléique. Les analogues de nucléotides synthétisés par des procédés de cette invention peuvent par conséquent être incorporés dans des oligonucléotides ou des polynucléotides, déprotégés et dérivés avec un groupe fonctionnel. Dans certains cas, les groupes protecteurs sont eux-mêmes antigéniques et peuvent être laissés sur les oligonucléotides ou polynucléotides pour des opérations de détection au moyen d'anticorps. Un procédé de synthèse d'oligonucléotides à l'aide d'un groupe fonctionnel utilisant les analogues de nucléotides faisant l'objet de cette invention est également présenté.

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