Base specific cleavage of methylation-specific amplification...

C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q

Patent

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Details

C12Q 1/68 (2006.01) C12P 19/34 (2006.01)

Patent

CA 2561381

Methods, combinations and kits are provided for identifying the methylation state of a target nucleic acid molecule, the methylate state of a nucleotide locus in a target nucleic acid molecule, or for identifying the locus of one or more methylated or unmethylated nucleotides in a target nucleic acid molecule. Methylation state identification is performed by treating a methylated target nucleic acid molecule with a reagent that modifies one or more nucleotides in the target nucleic acid molecule as a function of the methylation state of the target nucleic acid molecule, methylation specifically amplifying treated target nucleic acid molecule, fragmenting amplified products, and detecting one or more fragments to thereby identify the methylation state of a target nucleic acid molecule, the methylation state of a nucleotide locus in a target nucleic acid molecule, or the locus of one or more methylated or unmethylated nucleotides in a target nucleic acid molecule.

L'invention concerne des méthodes, des combinaisons et des kits permettant d'identifier l'état de méthylation d'une molécule d'acide nucléique cible, l'état de méthylation d'un locus de nucléotide dans une molécule d'acide nucléique cible ou d'identifier le locus d'au moins un nucléotide méthylé ou non méthylé dans une molécule d'acide nucléique cible. L'identification de l'état de méthylation est réalisée par traitement d'une molécule d'acide nucléique cible méthylée avec un réactif qui permet de modifier au moins un nucléotide dans la molécule d'acide nucléique en tant que fonction de l'état de méthylation de la molécule d'acide nucléique cible. Ladite méthylation permet notamment d'amplifier la molécule d'acide nucléique cible traitée, de fragmenter des produits amplifiés et de détecter au moins un fragment afin d'identifier l'état de méthylation d'une molécule d'acide nucléique cible, l'état de méthylation d'un locus de nucléotide dans une molécule d'acide nucléique cible ou le locus d'au moins un nucléotide méthylé ou non méthylé dans une molécule d'acide nucléique cible.

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